Protein–RNA interactions for Protein: B2KF05

Brpf3, Bromodomain and PHD finger-containing, 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf3B2KF05 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Brpf3B2KF05 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Brpf3B2KF05 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Brpf3B2KF05 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Brpf3B2KF05 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Brpf3B2KF05 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Brpf3B2KF05 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Brpf3B2KF05 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Brpf3B2KF05 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Brpf3B2KF05 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Brpf3B2KF05 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Brpf3B2KF05 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Brpf3B2KF05 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Brpf3B2KF05 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Brpf3B2KF05 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Brpf3B2KF05 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Brpf3B2KF05 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Brpf3B2KF05 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Brpf3B2KF05 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Brpf3B2KF05 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Brpf3B2KF05 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Brpf3B2KF05 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Brpf3B2KF05 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Brpf3B2KF05 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Brpf3B2KF05 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Brpf3B2KF05 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Brpf3B2KF05 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Brpf3B2KF05 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Brpf3B2KF05 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Brpf3B2KF05 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Brpf3B2KF05 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Brpf3B2KF05 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Brpf3B2KF05 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Brpf3B2KF05 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Brpf3B2KF05 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Brpf3B2KF05 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Brpf3B2KF05 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Brpf3B2KF05 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Brpf3B2KF05 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Brpf3B2KF05 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Brpf3B2KF05 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Brpf3B2KF05 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Brpf3B2KF05 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Brpf3B2KF05 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Brpf3B2KF05 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Brpf3B2KF05 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Brpf3B2KF05 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Brpf3B2KF05 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Brpf3B2KF05 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Brpf3B2KF05 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Brpf3B2KF05 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Brpf3B2KF05 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Brpf3B2KF05 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Brpf3B2KF05 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Brpf3B2KF05 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Brpf3B2KF05 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Brpf3B2KF05 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Brpf3B2KF05 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Brpf3B2KF05 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Brpf3B2KF05 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Brpf3B2KF05 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Brpf3B2KF05 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Brpf3B2KF05 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Brpf3B2KF05 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Brpf3B2KF05 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Brpf3B2KF05 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Brpf3B2KF05 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Brpf3B2KF05 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Brpf3B2KF05 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Brpf3B2KF05 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Brpf3B2KF05 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Brpf3B2KF05 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Brpf3B2KF05 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Brpf3B2KF05 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Brpf3B2KF05 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Brpf3B2KF05 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Brpf3B2KF05 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Brpf3B2KF05 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Brpf3B2KF05 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Brpf3B2KF05 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Brpf3B2KF05 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Brpf3B2KF05 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Brpf3B2KF05 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Brpf3B2KF05 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Brpf3B2KF05 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Brpf3B2KF05 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Brpf3B2KF05 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Brpf3B2KF05 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Brpf3B2KF05 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Brpf3B2KF05 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Brpf3B2KF05 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Brpf3B2KF05 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Brpf3B2KF05 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Brpf3B2KF05 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Brpf3B2KF05 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Brpf3B2KF05 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Brpf3B2KF05 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Brpf3B2KF05 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Brpf3B2KF05 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Brpf3B2KF05 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms