Protein–RNA interactions for Protein: B1B212

H60b, Histocompatibility antigen 60b, mousemouse

Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H60bB1B212 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H60bB1B212 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H60bB1B212 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
H60bB1B212 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
H60bB1B212 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
H60bB1B212 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
H60bB1B212 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
H60bB1B212 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
H60bB1B212 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
H60bB1B212 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
H60bB1B212 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H60bB1B212 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H60bB1B212 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H60bB1B212 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H60bB1B212 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H60bB1B212 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
H60bB1B212 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
H60bB1B212 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H60bB1B212 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H60bB1B212 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H60bB1B212 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H60bB1B212 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
H60bB1B212 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
H60bB1B212 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H60bB1B212 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
H60bB1B212 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H60bB1B212 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H60bB1B212 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H60bB1B212 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H60bB1B212 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H60bB1B212 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H60bB1B212 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H60bB1B212 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H60bB1B212 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H60bB1B212 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
H60bB1B212 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H60bB1B212 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H60bB1B212 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H60bB1B212 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
H60bB1B212 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
H60bB1B212 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
H60bB1B212 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
H60bB1B212 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
H60bB1B212 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
H60bB1B212 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
H60bB1B212 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
H60bB1B212 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
H60bB1B212 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H60bB1B212 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
H60bB1B212 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H60bB1B212 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H60bB1B212 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
H60bB1B212 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
H60bB1B212 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
H60bB1B212 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
H60bB1B212 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
H60bB1B212 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
H60bB1B212 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H60bB1B212 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
H60bB1B212 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H60bB1B212 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H60bB1B212 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
H60bB1B212 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H60bB1B212 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H60bB1B212 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H60bB1B212 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
H60bB1B212 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H60bB1B212 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
H60bB1B212 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H60bB1B212 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
H60bB1B212 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
H60bB1B212 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H60bB1B212 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H60bB1B212 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
H60bB1B212 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H60bB1B212 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H60bB1B212 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H60bB1B212 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H60bB1B212 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H60bB1B212 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H60bB1B212 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
H60bB1B212 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
H60bB1B212 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
H60bB1B212 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
H60bB1B212 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
H60bB1B212 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
H60bB1B212 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
H60bB1B212 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
H60bB1B212 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
H60bB1B212 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
H60bB1B212 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
H60bB1B212 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
H60bB1B212 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
H60bB1B212 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
H60bB1B212 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
H60bB1B212 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
H60bB1B212 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
H60bB1B212 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
H60bB1B212 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
H60bB1B212 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms