Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
H2-M5A7VMS3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
H2-M5A7VMS3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
H2-M5A7VMS3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
H2-M5A7VMS3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
H2-M5A7VMS3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
H2-M5A7VMS3 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
H2-M5A7VMS3 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
H2-M5A7VMS3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
H2-M5A7VMS3 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
H2-M5A7VMS3 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
H2-M5A7VMS3 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
H2-M5A7VMS3 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
H2-M5A7VMS3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
H2-M5A7VMS3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
H2-M5A7VMS3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
H2-M5A7VMS3 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
H2-M5A7VMS3 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
H2-M5A7VMS3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
H2-M5A7VMS3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
H2-M5A7VMS3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
H2-M5A7VMS3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
H2-M5A7VMS3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
H2-M5A7VMS3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
H2-M5A7VMS3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
H2-M5A7VMS3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
H2-M5A7VMS3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
H2-M5A7VMS3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
H2-M5A7VMS3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
H2-M5A7VMS3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
H2-M5A7VMS3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
H2-M5A7VMS3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
H2-M5A7VMS3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
H2-M5A7VMS3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
H2-M5A7VMS3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
H2-M5A7VMS3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
H2-M5A7VMS3 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
H2-M5A7VMS3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
H2-M5A7VMS3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
H2-M5A7VMS3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
H2-M5A7VMS3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
H2-M5A7VMS3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
H2-M5A7VMS3 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
H2-M5A7VMS3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
H2-M5A7VMS3 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
H2-M5A7VMS3 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
H2-M5A7VMS3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
H2-M5A7VMS3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
H2-M5A7VMS3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
H2-M5A7VMS3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
H2-M5A7VMS3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
H2-M5A7VMS3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
H2-M5A7VMS3 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
H2-M5A7VMS3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
H2-M5A7VMS3 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
H2-M5A7VMS3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
H2-M5A7VMS3 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
H2-M5A7VMS3 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
H2-M5A7VMS3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
H2-M5A7VMS3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
H2-M5A7VMS3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
H2-M5A7VMS3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
H2-M5A7VMS3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
H2-M5A7VMS3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
H2-M5A7VMS3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
H2-M5A7VMS3 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
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H2-M5A7VMS3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
H2-M5A7VMS3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
H2-M5A7VMS3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
H2-M5A7VMS3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
H2-M5A7VMS3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
H2-M5A7VMS3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
H2-M5A7VMS3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
H2-M5A7VMS3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
H2-M5A7VMS3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
H2-M5A7VMS3 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
H2-M5A7VMS3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
H2-M5A7VMS3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
H2-M5A7VMS3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
H2-M5A7VMS3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
H2-M5A7VMS3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
H2-M5A7VMS3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
H2-M5A7VMS3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
H2-M5A7VMS3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
H2-M5A7VMS3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
H2-M5A7VMS3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
H2-M5A7VMS3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
H2-M5A7VMS3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
H2-M5A7VMS3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
H2-M5A7VMS3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
H2-M5A7VMS3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
H2-M5A7VMS3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
H2-M5A7VMS3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
H2-M5A7VMS3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
H2-M5A7VMS3 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
H2-M5A7VMS3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
H2-M5A7VMS3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
H2-M5A7VMS3 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
H2-M5A7VMS3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
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