Protein–RNA interactions for Protein: A3KG49

Gm5640, Predicted gene 5640, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5640A3KG49 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm5640A3KG49 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm5640A3KG49 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm5640A3KG49 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm5640A3KG49 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm5640A3KG49 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm5640A3KG49 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm5640A3KG49 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm5640A3KG49 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm5640A3KG49 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm5640A3KG49 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm5640A3KG49 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm5640A3KG49 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm5640A3KG49 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm5640A3KG49 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm5640A3KG49 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm5640A3KG49 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm5640A3KG49 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm5640A3KG49 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm5640A3KG49 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm5640A3KG49 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Gm5640A3KG49 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Gm5640A3KG49 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm5640A3KG49 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm5640A3KG49 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm5640A3KG49 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm5640A3KG49 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm5640A3KG49 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm5640A3KG49 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm5640A3KG49 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm5640A3KG49 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm5640A3KG49 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm5640A3KG49 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm5640A3KG49 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm5640A3KG49 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm5640A3KG49 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm5640A3KG49 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm5640A3KG49 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm5640A3KG49 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm5640A3KG49 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm5640A3KG49 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm5640A3KG49 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm5640A3KG49 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm5640A3KG49 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm5640A3KG49 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Gm5640A3KG49 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm5640A3KG49 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm5640A3KG49 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm5640A3KG49 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm5640A3KG49 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm5640A3KG49 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm5640A3KG49 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm5640A3KG49 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm5640A3KG49 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm5640A3KG49 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm5640A3KG49 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm5640A3KG49 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm5640A3KG49 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm5640A3KG49 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm5640A3KG49 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm5640A3KG49 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm5640A3KG49 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm5640A3KG49 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm5640A3KG49 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm5640A3KG49 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm5640A3KG49 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm5640A3KG49 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm5640A3KG49 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm5640A3KG49 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm5640A3KG49 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm5640A3KG49 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm5640A3KG49 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm5640A3KG49 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm5640A3KG49 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm5640A3KG49 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm5640A3KG49 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm5640A3KG49 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm5640A3KG49 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm5640A3KG49 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm5640A3KG49 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm5640A3KG49 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm5640A3KG49 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm5640A3KG49 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm5640A3KG49 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm5640A3KG49 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm5640A3KG49 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm5640A3KG49 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm5640A3KG49 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm5640A3KG49 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm5640A3KG49 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm5640A3KG49 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm5640A3KG49 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm5640A3KG49 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm5640A3KG49 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm5640A3KG49 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm5640A3KG49 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm5640A3KG49 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm5640A3KG49 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm5640A3KG49 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm5640A3KG49 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms