Protein–RNA interactions for Protein: A2RSL7

4931406B18Rik, RIKEN cDNA 4931406B18 gene, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931406B18RikA2RSL7 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
4931406B18RikA2RSL7 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
4931406B18RikA2RSL7 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
4931406B18RikA2RSL7 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
4931406B18RikA2RSL7 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
4931406B18RikA2RSL7 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
4931406B18RikA2RSL7 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
4931406B18RikA2RSL7 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
4931406B18RikA2RSL7 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
4931406B18RikA2RSL7 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
4931406B18RikA2RSL7 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
4931406B18RikA2RSL7 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
4931406B18RikA2RSL7 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
4931406B18RikA2RSL7 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
4931406B18RikA2RSL7 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
4931406B18RikA2RSL7 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
4931406B18RikA2RSL7 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
4931406B18RikA2RSL7 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
4931406B18RikA2RSL7 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
4931406B18RikA2RSL7 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
4931406B18RikA2RSL7 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
4931406B18RikA2RSL7 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
4931406B18RikA2RSL7 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
4931406B18RikA2RSL7 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
4931406B18RikA2RSL7 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
4931406B18RikA2RSL7 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
4931406B18RikA2RSL7 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
4931406B18RikA2RSL7 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
4931406B18RikA2RSL7 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
4931406B18RikA2RSL7 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
4931406B18RikA2RSL7 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
4931406B18RikA2RSL7 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
4931406B18RikA2RSL7 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
4931406B18RikA2RSL7 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
4931406B18RikA2RSL7 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
4931406B18RikA2RSL7 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
4931406B18RikA2RSL7 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
4931406B18RikA2RSL7 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
4931406B18RikA2RSL7 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
4931406B18RikA2RSL7 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
4931406B18RikA2RSL7 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
4931406B18RikA2RSL7 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
4931406B18RikA2RSL7 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
4931406B18RikA2RSL7 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
4931406B18RikA2RSL7 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
4931406B18RikA2RSL7 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
4931406B18RikA2RSL7 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
4931406B18RikA2RSL7 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
4931406B18RikA2RSL7 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
4931406B18RikA2RSL7 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
4931406B18RikA2RSL7 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
4931406B18RikA2RSL7 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
4931406B18RikA2RSL7 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
4931406B18RikA2RSL7 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
4931406B18RikA2RSL7 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
4931406B18RikA2RSL7 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
4931406B18RikA2RSL7 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
4931406B18RikA2RSL7 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
4931406B18RikA2RSL7 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
4931406B18RikA2RSL7 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
4931406B18RikA2RSL7 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
4931406B18RikA2RSL7 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
4931406B18RikA2RSL7 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
4931406B18RikA2RSL7 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
4931406B18RikA2RSL7 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
4931406B18RikA2RSL7 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
4931406B18RikA2RSL7 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
4931406B18RikA2RSL7 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
4931406B18RikA2RSL7 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
4931406B18RikA2RSL7 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
4931406B18RikA2RSL7 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
4931406B18RikA2RSL7 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
4931406B18RikA2RSL7 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
4931406B18RikA2RSL7 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
4931406B18RikA2RSL7 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
4931406B18RikA2RSL7 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
4931406B18RikA2RSL7 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
4931406B18RikA2RSL7 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
4931406B18RikA2RSL7 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
4931406B18RikA2RSL7 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
4931406B18RikA2RSL7 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
4931406B18RikA2RSL7 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
4931406B18RikA2RSL7 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
4931406B18RikA2RSL7 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
4931406B18RikA2RSL7 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
4931406B18RikA2RSL7 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
4931406B18RikA2RSL7 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
4931406B18RikA2RSL7 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
4931406B18RikA2RSL7 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
4931406B18RikA2RSL7 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
4931406B18RikA2RSL7 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
4931406B18RikA2RSL7 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
4931406B18RikA2RSL7 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
4931406B18RikA2RSL7 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
4931406B18RikA2RSL7 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
4931406B18RikA2RSL7 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
4931406B18RikA2RSL7 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
4931406B18RikA2RSL7 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
4931406B18RikA2RSL7 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
4931406B18RikA2RSL7 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms