Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Syndig1A2ANU3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Syndig1A2ANU3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Syndig1A2ANU3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Syndig1A2ANU3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Syndig1A2ANU3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Syndig1A2ANU3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Syndig1A2ANU3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Syndig1A2ANU3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Syndig1A2ANU3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Syndig1A2ANU3 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Syndig1A2ANU3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Syndig1A2ANU3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Syndig1A2ANU3 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Syndig1A2ANU3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Syndig1A2ANU3 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Syndig1A2ANU3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Syndig1A2ANU3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Syndig1A2ANU3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Syndig1A2ANU3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Syndig1A2ANU3 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Syndig1A2ANU3 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Syndig1A2ANU3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Syndig1A2ANU3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Syndig1A2ANU3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Syndig1A2ANU3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Syndig1A2ANU3 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Syndig1A2ANU3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Syndig1A2ANU3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Syndig1A2ANU3 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Syndig1A2ANU3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Syndig1A2ANU3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Syndig1A2ANU3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Syndig1A2ANU3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Syndig1A2ANU3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Syndig1A2ANU3 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Syndig1A2ANU3 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Syndig1A2ANU3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Syndig1A2ANU3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Syndig1A2ANU3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Syndig1A2ANU3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Syndig1A2ANU3 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Syndig1A2ANU3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Syndig1A2ANU3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Syndig1A2ANU3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Syndig1A2ANU3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Syndig1A2ANU3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Syndig1A2ANU3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Syndig1A2ANU3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Syndig1A2ANU3 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Syndig1A2ANU3 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Syndig1A2ANU3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Syndig1A2ANU3 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Syndig1A2ANU3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Syndig1A2ANU3 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Syndig1A2ANU3 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Syndig1A2ANU3 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Syndig1A2ANU3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Syndig1A2ANU3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Syndig1A2ANU3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Syndig1A2ANU3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Syndig1A2ANU3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Syndig1A2ANU3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Syndig1A2ANU3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Syndig1A2ANU3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Syndig1A2ANU3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Syndig1A2ANU3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Syndig1A2ANU3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Syndig1A2ANU3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Syndig1A2ANU3 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Syndig1A2ANU3 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Syndig1A2ANU3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Syndig1A2ANU3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Syndig1A2ANU3 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Syndig1A2ANU3 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Syndig1A2ANU3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Syndig1A2ANU3 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Syndig1A2ANU3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Syndig1A2ANU3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Syndig1A2ANU3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Syndig1A2ANU3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Syndig1A2ANU3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Syndig1A2ANU3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Syndig1A2ANU3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Syndig1A2ANU3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Syndig1A2ANU3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Syndig1A2ANU3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Syndig1A2ANU3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Syndig1A2ANU3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Syndig1A2ANU3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Syndig1A2ANU3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Syndig1A2ANU3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Syndig1A2ANU3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Syndig1A2ANU3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Syndig1A2ANU3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Syndig1A2ANU3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Syndig1A2ANU3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Syndig1A2ANU3 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Syndig1A2ANU3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Syndig1A2ANU3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms