Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB1

Ccdc183, Coiled-coil domain-containing protein 183, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc183A2AJB1 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Ccdc183A2AJB1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ccdc183A2AJB1 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ccdc183A2AJB1 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ccdc183A2AJB1 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Ccdc183A2AJB1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Ccdc183A2AJB1 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Ccdc183A2AJB1 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ccdc183A2AJB1 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ccdc183A2AJB1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ccdc183A2AJB1 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccdc183A2AJB1 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccdc183A2AJB1 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccdc183A2AJB1 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ccdc183A2AJB1 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ccdc183A2AJB1 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ccdc183A2AJB1 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ccdc183A2AJB1 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ccdc183A2AJB1 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ccdc183A2AJB1 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ccdc183A2AJB1 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ccdc183A2AJB1 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ccdc183A2AJB1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ccdc183A2AJB1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ccdc183A2AJB1 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ccdc183A2AJB1 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Ccdc183A2AJB1 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Ccdc183A2AJB1 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Ccdc183A2AJB1 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ccdc183A2AJB1 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ccdc183A2AJB1 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ccdc183A2AJB1 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ccdc183A2AJB1 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ccdc183A2AJB1 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ccdc183A2AJB1 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ccdc183A2AJB1 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ccdc183A2AJB1 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Ccdc183A2AJB1 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ccdc183A2AJB1 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ccdc183A2AJB1 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ccdc183A2AJB1 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ccdc183A2AJB1 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Ccdc183A2AJB1 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ccdc183A2AJB1 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ccdc183A2AJB1 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ccdc183A2AJB1 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ccdc183A2AJB1 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ccdc183A2AJB1 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ccdc183A2AJB1 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ccdc183A2AJB1 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ccdc183A2AJB1 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ccdc183A2AJB1 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ccdc183A2AJB1 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ccdc183A2AJB1 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ccdc183A2AJB1 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ccdc183A2AJB1 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ccdc183A2AJB1 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Ccdc183A2AJB1 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Ccdc183A2AJB1 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ccdc183A2AJB1 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ccdc183A2AJB1 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ccdc183A2AJB1 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ccdc183A2AJB1 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ccdc183A2AJB1 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Ccdc183A2AJB1 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ccdc183A2AJB1 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ccdc183A2AJB1 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ccdc183A2AJB1 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ccdc183A2AJB1 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ccdc183A2AJB1 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ccdc183A2AJB1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ccdc183A2AJB1 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ccdc183A2AJB1 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ccdc183A2AJB1 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Ccdc183A2AJB1 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ccdc183A2AJB1 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ccdc183A2AJB1 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ccdc183A2AJB1 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ccdc183A2AJB1 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ccdc183A2AJB1 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ccdc183A2AJB1 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ccdc183A2AJB1 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ccdc183A2AJB1 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Ccdc183A2AJB1 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Ccdc183A2AJB1 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ccdc183A2AJB1 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ccdc183A2AJB1 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ccdc183A2AJB1 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ccdc183A2AJB1 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ccdc183A2AJB1 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ccdc183A2AJB1 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ccdc183A2AJB1 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ccdc183A2AJB1 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ccdc183A2AJB1 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ccdc183A2AJB1 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ccdc183A2AJB1 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ccdc183A2AJB1 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ccdc183A2AJB1 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ccdc183A2AJB1 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Ccdc183A2AJB1 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms