Protein–RNA interactions for Protein: A2AGU5

Cldn34d, Claudin 34D, mousemouse

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34dA2AGU5 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cldn34dA2AGU5 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cldn34dA2AGU5 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cldn34dA2AGU5 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cldn34dA2AGU5 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cldn34dA2AGU5 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cldn34dA2AGU5 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Cldn34dA2AGU5 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cldn34dA2AGU5 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cldn34dA2AGU5 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cldn34dA2AGU5 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cldn34dA2AGU5 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cldn34dA2AGU5 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cldn34dA2AGU5 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cldn34dA2AGU5 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cldn34dA2AGU5 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cldn34dA2AGU5 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cldn34dA2AGU5 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cldn34dA2AGU5 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cldn34dA2AGU5 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Cldn34dA2AGU5 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cldn34dA2AGU5 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cldn34dA2AGU5 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cldn34dA2AGU5 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cldn34dA2AGU5 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Cldn34dA2AGU5 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cldn34dA2AGU5 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cldn34dA2AGU5 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cldn34dA2AGU5 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Cldn34dA2AGU5 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cldn34dA2AGU5 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cldn34dA2AGU5 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cldn34dA2AGU5 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cldn34dA2AGU5 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cldn34dA2AGU5 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cldn34dA2AGU5 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cldn34dA2AGU5 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cldn34dA2AGU5 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cldn34dA2AGU5 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cldn34dA2AGU5 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cldn34dA2AGU5 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cldn34dA2AGU5 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cldn34dA2AGU5 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cldn34dA2AGU5 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cldn34dA2AGU5 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cldn34dA2AGU5 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cldn34dA2AGU5 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cldn34dA2AGU5 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cldn34dA2AGU5 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cldn34dA2AGU5 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cldn34dA2AGU5 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cldn34dA2AGU5 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cldn34dA2AGU5 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cldn34dA2AGU5 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cldn34dA2AGU5 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cldn34dA2AGU5 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cldn34dA2AGU5 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cldn34dA2AGU5 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cldn34dA2AGU5 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cldn34dA2AGU5 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cldn34dA2AGU5 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Cldn34dA2AGU5 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cldn34dA2AGU5 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cldn34dA2AGU5 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cldn34dA2AGU5 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cldn34dA2AGU5 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cldn34dA2AGU5 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cldn34dA2AGU5 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cldn34dA2AGU5 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cldn34dA2AGU5 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cldn34dA2AGU5 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cldn34dA2AGU5 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cldn34dA2AGU5 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cldn34dA2AGU5 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cldn34dA2AGU5 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cldn34dA2AGU5 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cldn34dA2AGU5 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cldn34dA2AGU5 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cldn34dA2AGU5 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cldn34dA2AGU5 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cldn34dA2AGU5 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cldn34dA2AGU5 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Cldn34dA2AGU5 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldn34dA2AGU5 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldn34dA2AGU5 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldn34dA2AGU5 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldn34dA2AGU5 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldn34dA2AGU5 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldn34dA2AGU5 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldn34dA2AGU5 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldn34dA2AGU5 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldn34dA2AGU5 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldn34dA2AGU5 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldn34dA2AGU5 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cldn34dA2AGU5 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cldn34dA2AGU5 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cldn34dA2AGU5 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cldn34dA2AGU5 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cldn34dA2AGU5 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cldn34dA2AGU5 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.8 ms