Protein–RNA interactions for Protein: A2A6Q5

Cdc27, Cell division cycle protein 27 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc27A2A6Q5 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cdc27A2A6Q5 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cdc27A2A6Q5 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cdc27A2A6Q5 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cdc27A2A6Q5 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cdc27A2A6Q5 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cdc27A2A6Q5 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cdc27A2A6Q5 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Cdc27A2A6Q5 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cdc27A2A6Q5 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cdc27A2A6Q5 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cdc27A2A6Q5 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Cdc27A2A6Q5 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cdc27A2A6Q5 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cdc27A2A6Q5 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cdc27A2A6Q5 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cdc27A2A6Q5 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cdc27A2A6Q5 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cdc27A2A6Q5 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cdc27A2A6Q5 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Cdc27A2A6Q5 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cdc27A2A6Q5 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cdc27A2A6Q5 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cdc27A2A6Q5 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cdc27A2A6Q5 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cdc27A2A6Q5 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cdc27A2A6Q5 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cdc27A2A6Q5 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cdc27A2A6Q5 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Cdc27A2A6Q5 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cdc27A2A6Q5 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cdc27A2A6Q5 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cdc27A2A6Q5 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cdc27A2A6Q5 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cdc27A2A6Q5 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cdc27A2A6Q5 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cdc27A2A6Q5 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cdc27A2A6Q5 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cdc27A2A6Q5 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cdc27A2A6Q5 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cdc27A2A6Q5 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cdc27A2A6Q5 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cdc27A2A6Q5 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Cdc27A2A6Q5 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cdc27A2A6Q5 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cdc27A2A6Q5 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cdc27A2A6Q5 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cdc27A2A6Q5 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cdc27A2A6Q5 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cdc27A2A6Q5 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cdc27A2A6Q5 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cdc27A2A6Q5 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cdc27A2A6Q5 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cdc27A2A6Q5 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cdc27A2A6Q5 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cdc27A2A6Q5 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cdc27A2A6Q5 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cdc27A2A6Q5 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cdc27A2A6Q5 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cdc27A2A6Q5 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cdc27A2A6Q5 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.6
Cdc27A2A6Q5 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cdc27A2A6Q5 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cdc27A2A6Q5 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cdc27A2A6Q5 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cdc27A2A6Q5 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Cdc27A2A6Q5 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Cdc27A2A6Q5 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cdc27A2A6Q5 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cdc27A2A6Q5 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Cdc27A2A6Q5 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cdc27A2A6Q5 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Cdc27A2A6Q5 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cdc27A2A6Q5 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Cdc27A2A6Q5 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cdc27A2A6Q5 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cdc27A2A6Q5 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cdc27A2A6Q5 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cdc27A2A6Q5 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cdc27A2A6Q5 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cdc27A2A6Q5 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cdc27A2A6Q5 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cdc27A2A6Q5 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cdc27A2A6Q5 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cdc27A2A6Q5 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cdc27A2A6Q5 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cdc27A2A6Q5 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cdc27A2A6Q5 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cdc27A2A6Q5 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cdc27A2A6Q5 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cdc27A2A6Q5 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cdc27A2A6Q5 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cdc27A2A6Q5 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cdc27A2A6Q5 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Cdc27A2A6Q5 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cdc27A2A6Q5 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cdc27A2A6Q5 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cdc27A2A6Q5 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cdc27A2A6Q5 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Cdc27A2A6Q5 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.7 ms