Protein–RNA interactions for Protein: A0A286YCQ6

Uncharacterized protein, mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A286YCQ6 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
A0A286YCQ6 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
A0A286YCQ6 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
A0A286YCQ6 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
A0A286YCQ6 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
A0A286YCQ6 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
A0A286YCQ6 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
A0A286YCQ6 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
A0A286YCQ6 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
A0A286YCQ6 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
A0A286YCQ6 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
A0A286YCQ6 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
A0A286YCQ6 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.47
A0A286YCQ6 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
A0A286YCQ6 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
A0A286YCQ6 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
A0A286YCQ6 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
A0A286YCQ6 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
A0A286YCQ6 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
A0A286YCQ6 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
A0A286YCQ6 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
A0A286YCQ6 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
A0A286YCQ6 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
A0A286YCQ6 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
A0A286YCQ6 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
A0A286YCQ6 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
A0A286YCQ6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
A0A286YCQ6 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
A0A286YCQ6 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
A0A286YCQ6 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
A0A286YCQ6 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
A0A286YCQ6 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
A0A286YCQ6 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
A0A286YCQ6 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
A0A286YCQ6 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
A0A286YCQ6 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
A0A286YCQ6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
A0A286YCQ6 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
A0A286YCQ6 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
A0A286YCQ6 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
A0A286YCQ6 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
A0A286YCQ6 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
A0A286YCQ6 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
A0A286YCQ6 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
A0A286YCQ6 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
A0A286YCQ6 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
A0A286YCQ6 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
A0A286YCQ6 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
A0A286YCQ6 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
A0A286YCQ6 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
A0A286YCQ6 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
A0A286YCQ6 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
A0A286YCQ6 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
A0A286YCQ6 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
A0A286YCQ6 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
A0A286YCQ6 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
A0A286YCQ6 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
A0A286YCQ6 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
A0A286YCQ6 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
A0A286YCQ6 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
A0A286YCQ6 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
A0A286YCQ6 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
A0A286YCQ6 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
A0A286YCQ6 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
A0A286YCQ6 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
A0A286YCQ6 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
A0A286YCQ6 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
A0A286YCQ6 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
A0A286YCQ6 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
A0A286YCQ6 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
A0A286YCQ6 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
A0A286YCQ6 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
A0A286YCQ6 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
A0A286YCQ6 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
A0A286YCQ6 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
A0A286YCQ6 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
A0A286YCQ6 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
A0A286YCQ6 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
A0A286YCQ6 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
A0A286YCQ6 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
A0A286YCQ6 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
A0A286YCQ6 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
A0A286YCQ6 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
A0A286YCQ6 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
A0A286YCQ6 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
A0A286YCQ6 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
A0A286YCQ6 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
A0A286YCQ6 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
A0A286YCQ6 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
A0A286YCQ6 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
A0A286YCQ6 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
A0A286YCQ6 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
A0A286YCQ6 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
A0A286YCQ6 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
A0A286YCQ6 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
A0A286YCQ6 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
A0A286YCQ6 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
A0A286YCQ6 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
A0A286YCQ6 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
A0A286YCQ6 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms