Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RP08

1700028J19Rik, RIKEN cDNA 1700028J19 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
1700028J19RikA0A0U1RP08 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
1700028J19RikA0A0U1RP08 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
1700028J19RikA0A0U1RP08 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
1700028J19RikA0A0U1RP08 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
1700028J19RikA0A0U1RP08 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
1700028J19RikA0A0U1RP08 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
1700028J19RikA0A0U1RP08 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
1700028J19RikA0A0U1RP08 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
1700028J19RikA0A0U1RP08 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
1700028J19RikA0A0U1RP08 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
1700028J19RikA0A0U1RP08 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
1700028J19RikA0A0U1RP08 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
1700028J19RikA0A0U1RP08 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
1700028J19RikA0A0U1RP08 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
1700028J19RikA0A0U1RP08 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
1700028J19RikA0A0U1RP08 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
1700028J19RikA0A0U1RP08 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
1700028J19RikA0A0U1RP08 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
1700028J19RikA0A0U1RP08 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
1700028J19RikA0A0U1RP08 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
1700028J19RikA0A0U1RP08 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
1700028J19RikA0A0U1RP08 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
1700028J19RikA0A0U1RP08 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
1700028J19RikA0A0U1RP08 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
1700028J19RikA0A0U1RP08 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
1700028J19RikA0A0U1RP08 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
1700028J19RikA0A0U1RP08 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
1700028J19RikA0A0U1RP08 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
1700028J19RikA0A0U1RP08 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
1700028J19RikA0A0U1RP08 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
1700028J19RikA0A0U1RP08 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
1700028J19RikA0A0U1RP08 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
1700028J19RikA0A0U1RP08 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
1700028J19RikA0A0U1RP08 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
1700028J19RikA0A0U1RP08 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
1700028J19RikA0A0U1RP08 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
1700028J19RikA0A0U1RP08 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
1700028J19RikA0A0U1RP08 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
1700028J19RikA0A0U1RP08 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
1700028J19RikA0A0U1RP08 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
1700028J19RikA0A0U1RP08 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
1700028J19RikA0A0U1RP08 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
1700028J19RikA0A0U1RP08 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
1700028J19RikA0A0U1RP08 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
1700028J19RikA0A0U1RP08 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
1700028J19RikA0A0U1RP08 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
1700028J19RikA0A0U1RP08 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
1700028J19RikA0A0U1RP08 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
1700028J19RikA0A0U1RP08 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
1700028J19RikA0A0U1RP08 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
1700028J19RikA0A0U1RP08 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
1700028J19RikA0A0U1RP08 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
1700028J19RikA0A0U1RP08 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
1700028J19RikA0A0U1RP08 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
1700028J19RikA0A0U1RP08 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
1700028J19RikA0A0U1RP08 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
1700028J19RikA0A0U1RP08 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
1700028J19RikA0A0U1RP08 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
1700028J19RikA0A0U1RP08 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
1700028J19RikA0A0U1RP08 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
1700028J19RikA0A0U1RP08 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
1700028J19RikA0A0U1RP08 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms