Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WQ19

Gm28171, Predicted gene 28171, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28171A0A087WQ19 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm28171A0A087WQ19 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm28171A0A087WQ19 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm28171A0A087WQ19 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm28171A0A087WQ19 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm28171A0A087WQ19 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm28171A0A087WQ19 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm28171A0A087WQ19 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm28171A0A087WQ19 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm28171A0A087WQ19 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm28171A0A087WQ19 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm28171A0A087WQ19 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm28171A0A087WQ19 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm28171A0A087WQ19 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm28171A0A087WQ19 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm28171A0A087WQ19 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm28171A0A087WQ19 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm28171A0A087WQ19 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm28171A0A087WQ19 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm28171A0A087WQ19 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm28171A0A087WQ19 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm28171A0A087WQ19 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm28171A0A087WQ19 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm28171A0A087WQ19 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm28171A0A087WQ19 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm28171A0A087WQ19 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm28171A0A087WQ19 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm28171A0A087WQ19 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm28171A0A087WQ19 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm28171A0A087WQ19 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm28171A0A087WQ19 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm28171A0A087WQ19 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm28171A0A087WQ19 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm28171A0A087WQ19 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm28171A0A087WQ19 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm28171A0A087WQ19 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm28171A0A087WQ19 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm28171A0A087WQ19 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm28171A0A087WQ19 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm28171A0A087WQ19 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm28171A0A087WQ19 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm28171A0A087WQ19 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm28171A0A087WQ19 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm28171A0A087WQ19 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm28171A0A087WQ19 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm28171A0A087WQ19 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm28171A0A087WQ19 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm28171A0A087WQ19 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm28171A0A087WQ19 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm28171A0A087WQ19 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm28171A0A087WQ19 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm28171A0A087WQ19 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm28171A0A087WQ19 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm28171A0A087WQ19 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm28171A0A087WQ19 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm28171A0A087WQ19 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm28171A0A087WQ19 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm28171A0A087WQ19 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm28171A0A087WQ19 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm28171A0A087WQ19 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm28171A0A087WQ19 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm28171A0A087WQ19 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm28171A0A087WQ19 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm28171A0A087WQ19 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm28171A0A087WQ19 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm28171A0A087WQ19 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm28171A0A087WQ19 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm28171A0A087WQ19 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm28171A0A087WQ19 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm28171A0A087WQ19 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm28171A0A087WQ19 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm28171A0A087WQ19 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm28171A0A087WQ19 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm28171A0A087WQ19 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm28171A0A087WQ19 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm28171A0A087WQ19 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm28171A0A087WQ19 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm28171A0A087WQ19 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm28171A0A087WQ19 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm28171A0A087WQ19 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gm28171A0A087WQ19 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gm28171A0A087WQ19 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm28171A0A087WQ19 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm28171A0A087WQ19 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm28171A0A087WQ19 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm28171A0A087WQ19 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm28171A0A087WQ19 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm28171A0A087WQ19 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm28171A0A087WQ19 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm28171A0A087WQ19 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm28171A0A087WQ19 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm28171A0A087WQ19 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm28171A0A087WQ19 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm28171A0A087WQ19 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm28171A0A087WQ19 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm28171A0A087WQ19 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm28171A0A087WQ19 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm28171A0A087WQ19 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm28171A0A087WQ19 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm28171A0A087WQ19 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 122.7 ms