Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RhoP15409 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RhoP15409 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RhoP15409 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RhoP15409 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RhoP15409 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RhoP15409 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RhoP15409 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RhoP15409 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RhoP15409 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RhoP15409 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RhoP15409 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RhoP15409 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RhoP15409 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RhoP15409 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RhoP15409 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RhoP15409 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RhoP15409 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RhoP15409 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RhoP15409 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RhoP15409 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RhoP15409 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RhoP15409 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RhoP15409 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RhoP15409 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RhoP15409 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RhoP15409 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RhoP15409 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RhoP15409 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RhoP15409 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RhoP15409 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RhoP15409 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RhoP15409 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RhoP15409 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RhoP15409 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RhoP15409 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RhoP15409 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RhoP15409 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RhoP15409 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RhoP15409 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RhoP15409 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RhoP15409 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RhoP15409 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RhoP15409 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RhoP15409 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RhoP15409 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RhoP15409 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RhoP15409 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RhoP15409 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RhoP15409 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RhoP15409 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RhoP15409 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RhoP15409 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RhoP15409 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RhoP15409 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RhoP15409 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RhoP15409 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RhoP15409 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RhoP15409 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RhoP15409 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RhoP15409 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RhoP15409 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RhoP15409 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RhoP15409 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RhoP15409 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RhoP15409 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RhoP15409 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RhoP15409 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RhoP15409 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RhoP15409 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RhoP15409 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RhoP15409 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RhoP15409 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RhoP15409 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RhoP15409 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RhoP15409 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RhoP15409 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RhoP15409 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RhoP15409 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RhoP15409 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RhoP15409 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RhoP15409 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RhoP15409 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RhoP15409 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RhoP15409 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RhoP15409 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RhoP15409 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RhoP15409 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RhoP15409 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RhoP15409 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RhoP15409 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RhoP15409 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RhoP15409 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RhoP15409 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RhoP15409 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RhoP15409 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RhoP15409 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RhoP15409 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RhoP15409 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RhoP15409 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.1 ms