Protein–RNA interactions for Protein: O88737

Bsn, Protein bassoon, mousemouse

Predictions only

Length 3,942 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BsnO88737 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
BsnO88737 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
BsnO88737 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BsnO88737 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BsnO88737 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
BsnO88737 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BsnO88737 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BsnO88737 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BsnO88737 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BsnO88737 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
BsnO88737 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.55
BsnO88737 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.55
BsnO88737 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BsnO88737 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BsnO88737 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BsnO88737 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BsnO88737 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
BsnO88737 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BsnO88737 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BsnO88737 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BsnO88737 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BsnO88737 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BsnO88737 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
BsnO88737 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BsnO88737 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
BsnO88737 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BsnO88737 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BsnO88737 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BsnO88737 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BsnO88737 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
BsnO88737 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
BsnO88737 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BsnO88737 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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BsnO88737 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
BsnO88737 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
BsnO88737 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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BsnO88737 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
BsnO88737 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BsnO88737 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BsnO88737 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BsnO88737 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BsnO88737 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BsnO88737 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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BsnO88737 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BsnO88737 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
BsnO88737 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BsnO88737 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
BsnO88737 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BsnO88737 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BsnO88737 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BsnO88737 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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BsnO88737 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
BsnO88737 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
BsnO88737 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
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BsnO88737 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BsnO88737 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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BsnO88737 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BsnO88737 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BsnO88737 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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BsnO88737 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
BsnO88737 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
BsnO88737 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
BsnO88737 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BsnO88737 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BsnO88737 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
BsnO88737 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
BsnO88737 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BsnO88737 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
BsnO88737 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BsnO88737 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
BsnO88737 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
BsnO88737 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
BsnO88737 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
BsnO88737 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
BsnO88737 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
BsnO88737 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
BsnO88737 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
BsnO88737 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
BsnO88737 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
BsnO88737 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
BsnO88737 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
BsnO88737 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
BsnO88737 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
BsnO88737 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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