Protein–RNA interactions for Protein: P28741

Kif3a, Kinesin-like protein KIF3A, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif3aP28741 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Kif3aP28741 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Kif3aP28741 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Kif3aP28741 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Kif3aP28741 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Kif3aP28741 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Kif3aP28741 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Kif3aP28741 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Kif3aP28741 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Kif3aP28741 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Kif3aP28741 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Kif3aP28741 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Kif3aP28741 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Kif3aP28741 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Kif3aP28741 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Kif3aP28741 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Kif3aP28741 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kif3aP28741 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Kif3aP28741 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kif3aP28741 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kif3aP28741 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Kif3aP28741 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kif3aP28741 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kif3aP28741 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kif3aP28741 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kif3aP28741 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kif3aP28741 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kif3aP28741 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kif3aP28741 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Kif3aP28741 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kif3aP28741 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kif3aP28741 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kif3aP28741 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kif3aP28741 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kif3aP28741 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kif3aP28741 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kif3aP28741 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kif3aP28741 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kif3aP28741 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Kif3aP28741 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Kif3aP28741 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Kif3aP28741 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Kif3aP28741 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Kif3aP28741 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Kif3aP28741 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Kif3aP28741 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Kif3aP28741 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Kif3aP28741 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Kif3aP28741 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Kif3aP28741 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Kif3aP28741 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Kif3aP28741 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Kif3aP28741 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Kif3aP28741 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Kif3aP28741 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Kif3aP28741 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Kif3aP28741 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Kif3aP28741 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Kif3aP28741 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Kif3aP28741 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Kif3aP28741 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kif3aP28741 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kif3aP28741 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kif3aP28741 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kif3aP28741 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kif3aP28741 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kif3aP28741 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kif3aP28741 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kif3aP28741 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Kif3aP28741 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kif3aP28741 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kif3aP28741 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kif3aP28741 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kif3aP28741 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kif3aP28741 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kif3aP28741 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kif3aP28741 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kif3aP28741 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kif3aP28741 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kif3aP28741 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kif3aP28741 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kif3aP28741 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Kif3aP28741 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kif3aP28741 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kif3aP28741 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kif3aP28741 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kif3aP28741 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kif3aP28741 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kif3aP28741 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kif3aP28741 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kif3aP28741 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kif3aP28741 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kif3aP28741 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kif3aP28741 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kif3aP28741 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Kif3aP28741 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Kif3aP28741 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Kif3aP28741 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Kif3aP28741 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Kif3aP28741 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms