Protein–RNA interactions for Protein: P09026

Hoxb3, Homeobox protein Hox-B3, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb3P09026 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxb3P09026 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxb3P09026 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxb3P09026 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxb3P09026 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxb3P09026 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxb3P09026 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxb3P09026 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxb3P09026 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxb3P09026 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxb3P09026 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxb3P09026 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxb3P09026 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxb3P09026 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxb3P09026 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxb3P09026 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxb3P09026 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxb3P09026 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxb3P09026 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxb3P09026 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxb3P09026 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxb3P09026 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxb3P09026 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxb3P09026 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxb3P09026 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxb3P09026 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxb3P09026 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxb3P09026 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Hoxb3P09026 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxb3P09026 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxb3P09026 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxb3P09026 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxb3P09026 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxb3P09026 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxb3P09026 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxb3P09026 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxb3P09026 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxb3P09026 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxb3P09026 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxb3P09026 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxb3P09026 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxb3P09026 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxb3P09026 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxb3P09026 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxb3P09026 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxb3P09026 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxb3P09026 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxb3P09026 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxb3P09026 Gm21868-201ENSMUST00000185623 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxb3P09026 Gm20803-202ENSMUST00000190968 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxb3P09026 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxb3P09026 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxb3P09026 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxb3P09026 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxb3P09026 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxb3P09026 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxb3P09026 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxb3P09026 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxb3P09026 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxb3P09026 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxb3P09026 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Hoxb3P09026 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxb3P09026 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxb3P09026 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxb3P09026 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxb3P09026 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxb3P09026 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxb3P09026 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxb3P09026 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxb3P09026 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxb3P09026 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxb3P09026 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxb3P09026 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxb3P09026 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxb3P09026 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxb3P09026 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxb3P09026 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxb3P09026 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxb3P09026 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxb3P09026 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxb3P09026 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxb3P09026 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxb3P09026 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxb3P09026 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxb3P09026 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxb3P09026 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxb3P09026 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxb3P09026 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxb3P09026 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxb3P09026 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxb3P09026 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxb3P09026 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxb3P09026 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxb3P09026 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxb3P09026 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxb3P09026 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxb3P09026 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxb3P09026 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxb3P09026 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxb3P09026 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 141.5 ms