Protein–RNA interactions for Protein: P09026

Hoxb3, Homeobox protein Hox-B3, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb3P09026 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxb3P09026 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxb3P09026 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Hoxb3P09026 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxb3P09026 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxb3P09026 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxb3P09026 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxb3P09026 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxb3P09026 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxb3P09026 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxb3P09026 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxb3P09026 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxb3P09026 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxb3P09026 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxb3P09026 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxb3P09026 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxb3P09026 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxb3P09026 Gm28510-201ENSMUST00000190572 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxb3P09026 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxb3P09026 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxb3P09026 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxb3P09026 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxb3P09026 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxb3P09026 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxb3P09026 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxb3P09026 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxb3P09026 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxb3P09026 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxb3P09026 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxb3P09026 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxb3P09026 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxb3P09026 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Hoxb3P09026 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxb3P09026 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxb3P09026 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxb3P09026 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxb3P09026 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxb3P09026 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxb3P09026 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxb3P09026 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxb3P09026 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxb3P09026 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxb3P09026 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxb3P09026 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxb3P09026 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxb3P09026 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxb3P09026 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxb3P09026 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxb3P09026 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxb3P09026 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxb3P09026 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxb3P09026 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxb3P09026 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxb3P09026 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxb3P09026 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxb3P09026 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxb3P09026 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxb3P09026 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxb3P09026 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxb3P09026 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxb3P09026 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxb3P09026 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxb3P09026 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Hoxb3P09026 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxb3P09026 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxb3P09026 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxb3P09026 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxb3P09026 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxb3P09026 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxb3P09026 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxb3P09026 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxb3P09026 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxb3P09026 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxb3P09026 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxb3P09026 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxb3P09026 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxb3P09026 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxb3P09026 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxb3P09026 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxb3P09026 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxb3P09026 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxb3P09026 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxb3P09026 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxb3P09026 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxb3P09026 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxb3P09026 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxb3P09026 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxb3P09026 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxb3P09026 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxb3P09026 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxb3P09026 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxb3P09026 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxb3P09026 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxb3P09026 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxb3P09026 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxb3P09026 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxb3P09026 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxb3P09026 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxb3P09026 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Hoxb3P09026 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms