Protein–RNA interactions for Protein: A0A140LIP3

4933424G06Rik, RIKEN cDNA 4933424G06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933424G06RikA0A140LIP3 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
4933424G06RikA0A140LIP3 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
4933424G06RikA0A140LIP3 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
4933424G06RikA0A140LIP3 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
4933424G06RikA0A140LIP3 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
4933424G06RikA0A140LIP3 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
4933424G06RikA0A140LIP3 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
4933424G06RikA0A140LIP3 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4933424G06RikA0A140LIP3 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4933424G06RikA0A140LIP3 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
4933424G06RikA0A140LIP3 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
4933424G06RikA0A140LIP3 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4933424G06RikA0A140LIP3 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4933424G06RikA0A140LIP3 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
4933424G06RikA0A140LIP3 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4933424G06RikA0A140LIP3 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
4933424G06RikA0A140LIP3 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4933424G06RikA0A140LIP3 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
4933424G06RikA0A140LIP3 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
4933424G06RikA0A140LIP3 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4933424G06RikA0A140LIP3 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4933424G06RikA0A140LIP3 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
4933424G06RikA0A140LIP3 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4933424G06RikA0A140LIP3 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4933424G06RikA0A140LIP3 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
4933424G06RikA0A140LIP3 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4933424G06RikA0A140LIP3 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4933424G06RikA0A140LIP3 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4933424G06RikA0A140LIP3 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4933424G06RikA0A140LIP3 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
4933424G06RikA0A140LIP3 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4933424G06RikA0A140LIP3 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4933424G06RikA0A140LIP3 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
4933424G06RikA0A140LIP3 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
4933424G06RikA0A140LIP3 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
4933424G06RikA0A140LIP3 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
4933424G06RikA0A140LIP3 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4933424G06RikA0A140LIP3 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4933424G06RikA0A140LIP3 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4933424G06RikA0A140LIP3 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4933424G06RikA0A140LIP3 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4933424G06RikA0A140LIP3 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
4933424G06RikA0A140LIP3 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4933424G06RikA0A140LIP3 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
4933424G06RikA0A140LIP3 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4933424G06RikA0A140LIP3 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4933424G06RikA0A140LIP3 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4933424G06RikA0A140LIP3 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4933424G06RikA0A140LIP3 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4933424G06RikA0A140LIP3 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4933424G06RikA0A140LIP3 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
4933424G06RikA0A140LIP3 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
4933424G06RikA0A140LIP3 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4933424G06RikA0A140LIP3 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
4933424G06RikA0A140LIP3 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
4933424G06RikA0A140LIP3 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4933424G06RikA0A140LIP3 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
4933424G06RikA0A140LIP3 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4933424G06RikA0A140LIP3 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4933424G06RikA0A140LIP3 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
4933424G06RikA0A140LIP3 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
4933424G06RikA0A140LIP3 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
4933424G06RikA0A140LIP3 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
4933424G06RikA0A140LIP3 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
4933424G06RikA0A140LIP3 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4933424G06RikA0A140LIP3 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
4933424G06RikA0A140LIP3 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
4933424G06RikA0A140LIP3 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4933424G06RikA0A140LIP3 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4933424G06RikA0A140LIP3 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4933424G06RikA0A140LIP3 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4933424G06RikA0A140LIP3 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4933424G06RikA0A140LIP3 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4933424G06RikA0A140LIP3 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
4933424G06RikA0A140LIP3 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4933424G06RikA0A140LIP3 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4933424G06RikA0A140LIP3 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
4933424G06RikA0A140LIP3 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4933424G06RikA0A140LIP3 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4933424G06RikA0A140LIP3 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4933424G06RikA0A140LIP3 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4933424G06RikA0A140LIP3 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4933424G06RikA0A140LIP3 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
4933424G06RikA0A140LIP3 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
4933424G06RikA0A140LIP3 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4933424G06RikA0A140LIP3 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4933424G06RikA0A140LIP3 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
4933424G06RikA0A140LIP3 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
4933424G06RikA0A140LIP3 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4933424G06RikA0A140LIP3 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
4933424G06RikA0A140LIP3 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms