Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5C7

Znf728, Zinc finger protein 728, mousemouse

Predictions only

Length 752 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf728Q6P5C7 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Znf728Q6P5C7 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Znf728Q6P5C7 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Znf728Q6P5C7 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Znf728Q6P5C7 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Znf728Q6P5C7 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Znf728Q6P5C7 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Znf728Q6P5C7 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Znf728Q6P5C7 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Znf728Q6P5C7 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Znf728Q6P5C7 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Znf728Q6P5C7 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Znf728Q6P5C7 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Znf728Q6P5C7 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Znf728Q6P5C7 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Znf728Q6P5C7 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Znf728Q6P5C7 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Znf728Q6P5C7 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Znf728Q6P5C7 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Znf728Q6P5C7 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Znf728Q6P5C7 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Znf728Q6P5C7 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Znf728Q6P5C7 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Znf728Q6P5C7 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Znf728Q6P5C7 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Znf728Q6P5C7 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Znf728Q6P5C7 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Znf728Q6P5C7 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Znf728Q6P5C7 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Znf728Q6P5C7 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Znf728Q6P5C7 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Znf728Q6P5C7 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Znf728Q6P5C7 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Znf728Q6P5C7 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Znf728Q6P5C7 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Znf728Q6P5C7 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Znf728Q6P5C7 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Znf728Q6P5C7 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Znf728Q6P5C7 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Znf728Q6P5C7 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Znf728Q6P5C7 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Znf728Q6P5C7 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Znf728Q6P5C7 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Znf728Q6P5C7 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Znf728Q6P5C7 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Znf728Q6P5C7 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Znf728Q6P5C7 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Znf728Q6P5C7 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Znf728Q6P5C7 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Znf728Q6P5C7 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Znf728Q6P5C7 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Znf728Q6P5C7 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Znf728Q6P5C7 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Znf728Q6P5C7 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Znf728Q6P5C7 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Znf728Q6P5C7 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Znf728Q6P5C7 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Znf728Q6P5C7 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Znf728Q6P5C7 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Znf728Q6P5C7 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Znf728Q6P5C7 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Znf728Q6P5C7 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Znf728Q6P5C7 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Znf728Q6P5C7 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Znf728Q6P5C7 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Znf728Q6P5C7 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Znf728Q6P5C7 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Znf728Q6P5C7 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Znf728Q6P5C7 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Znf728Q6P5C7 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Znf728Q6P5C7 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Znf728Q6P5C7 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Znf728Q6P5C7 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Znf728Q6P5C7 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Znf728Q6P5C7 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Znf728Q6P5C7 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Znf728Q6P5C7 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Znf728Q6P5C7 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Znf728Q6P5C7 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Znf728Q6P5C7 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Znf728Q6P5C7 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Znf728Q6P5C7 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Znf728Q6P5C7 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Znf728Q6P5C7 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Znf728Q6P5C7 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Znf728Q6P5C7 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Znf728Q6P5C7 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Znf728Q6P5C7 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Znf728Q6P5C7 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Znf728Q6P5C7 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Znf728Q6P5C7 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Znf728Q6P5C7 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Znf728Q6P5C7 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Znf728Q6P5C7 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Znf728Q6P5C7 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Znf728Q6P5C7 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Znf728Q6P5C7 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Znf728Q6P5C7 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Znf728Q6P5C7 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Znf728Q6P5C7 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms