Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5C7

Znf728, Zinc finger protein 728, mousemouse

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Length 752 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf728Q6P5C7 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf728Q6P5C7 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf728Q6P5C7 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf728Q6P5C7 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf728Q6P5C7 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf728Q6P5C7 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf728Q6P5C7 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf728Q6P5C7 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf728Q6P5C7 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf728Q6P5C7 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf728Q6P5C7 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf728Q6P5C7 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf728Q6P5C7 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf728Q6P5C7 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf728Q6P5C7 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf728Q6P5C7 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf728Q6P5C7 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf728Q6P5C7 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf728Q6P5C7 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf728Q6P5C7 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf728Q6P5C7 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf728Q6P5C7 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf728Q6P5C7 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf728Q6P5C7 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf728Q6P5C7 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf728Q6P5C7 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf728Q6P5C7 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf728Q6P5C7 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf728Q6P5C7 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf728Q6P5C7 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf728Q6P5C7 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf728Q6P5C7 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf728Q6P5C7 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf728Q6P5C7 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf728Q6P5C7 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf728Q6P5C7 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf728Q6P5C7 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf728Q6P5C7 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf728Q6P5C7 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf728Q6P5C7 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf728Q6P5C7 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf728Q6P5C7 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf728Q6P5C7 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf728Q6P5C7 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf728Q6P5C7 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf728Q6P5C7 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf728Q6P5C7 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf728Q6P5C7 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf728Q6P5C7 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf728Q6P5C7 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf728Q6P5C7 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf728Q6P5C7 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf728Q6P5C7 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf728Q6P5C7 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf728Q6P5C7 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf728Q6P5C7 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf728Q6P5C7 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf728Q6P5C7 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf728Q6P5C7 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf728Q6P5C7 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf728Q6P5C7 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf728Q6P5C7 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf728Q6P5C7 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf728Q6P5C7 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf728Q6P5C7 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf728Q6P5C7 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf728Q6P5C7 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf728Q6P5C7 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf728Q6P5C7 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf728Q6P5C7 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf728Q6P5C7 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf728Q6P5C7 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf728Q6P5C7 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf728Q6P5C7 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Znf728Q6P5C7 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Znf728Q6P5C7 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Znf728Q6P5C7 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Znf728Q6P5C7 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Znf728Q6P5C7 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Znf728Q6P5C7 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Znf728Q6P5C7 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Znf728Q6P5C7 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Znf728Q6P5C7 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Znf728Q6P5C7 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Znf728Q6P5C7 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Znf728Q6P5C7 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Znf728Q6P5C7 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Znf728Q6P5C7 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Znf728Q6P5C7 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Znf728Q6P5C7 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Znf728Q6P5C7 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Znf728Q6P5C7 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Znf728Q6P5C7 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Znf728Q6P5C7 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Znf728Q6P5C7 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Znf728Q6P5C7 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Znf728Q6P5C7 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Znf728Q6P5C7 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Znf728Q6P5C7 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Znf728Q6P5C7 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms