Protein–RNA interactions for Protein: P09026

Hoxb3, Homeobox protein Hox-B3, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb3P09026 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxb3P09026 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxb3P09026 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxb3P09026 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxb3P09026 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxb3P09026 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxb3P09026 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxb3P09026 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxb3P09026 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxb3P09026 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxb3P09026 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxb3P09026 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxb3P09026 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxb3P09026 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxb3P09026 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxb3P09026 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxb3P09026 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxb3P09026 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxb3P09026 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxb3P09026 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxb3P09026 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxb3P09026 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxb3P09026 Gm44044-201ENSMUST00000205178 1089 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxb3P09026 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxb3P09026 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxb3P09026 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxb3P09026 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxb3P09026 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxb3P09026 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxb3P09026 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxb3P09026 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxb3P09026 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxb3P09026 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxb3P09026 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxb3P09026 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxb3P09026 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxb3P09026 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxb3P09026 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxb3P09026 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxb3P09026 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxb3P09026 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxb3P09026 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxb3P09026 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxb3P09026 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxb3P09026 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxb3P09026 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxb3P09026 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxb3P09026 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxb3P09026 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxb3P09026 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxb3P09026 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxb3P09026 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxb3P09026 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxb3P09026 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxb3P09026 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxb3P09026 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxb3P09026 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxb3P09026 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxb3P09026 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxb3P09026 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxb3P09026 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxb3P09026 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxb3P09026 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxb3P09026 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxb3P09026 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxb3P09026 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxb3P09026 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxb3P09026 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxb3P09026 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxb3P09026 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxb3P09026 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxb3P09026 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxb3P09026 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxb3P09026 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxb3P09026 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxb3P09026 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxb3P09026 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxb3P09026 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxb3P09026 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxb3P09026 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxb3P09026 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxb3P09026 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxb3P09026 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxb3P09026 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxb3P09026 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxb3P09026 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxb3P09026 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxb3P09026 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxb3P09026 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxb3P09026 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxb3P09026 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxb3P09026 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxb3P09026 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxb3P09026 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxb3P09026 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxb3P09026 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxb3P09026 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxb3P09026 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxb3P09026 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxb3P09026 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.3 ms