Protein–RNA interactions for Protein: P09026

Hoxb3, Homeobox protein Hox-B3, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb3P09026 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxb3P09026 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxb3P09026 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxb3P09026 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxb3P09026 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxb3P09026 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxb3P09026 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxb3P09026 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxb3P09026 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxb3P09026 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxb3P09026 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxb3P09026 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxb3P09026 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxb3P09026 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxb3P09026 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxb3P09026 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxb3P09026 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxb3P09026 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxb3P09026 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxb3P09026 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxb3P09026 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxb3P09026 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxb3P09026 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxb3P09026 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxb3P09026 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxb3P09026 Gm12106-201ENSMUST00000116006 1200 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxb3P09026 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxb3P09026 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxb3P09026 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxb3P09026 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxb3P09026 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxb3P09026 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxb3P09026 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxb3P09026 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxb3P09026 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxb3P09026 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxb3P09026 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxb3P09026 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxb3P09026 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxb3P09026 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxb3P09026 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxb3P09026 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxb3P09026 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxb3P09026 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxb3P09026 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxb3P09026 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxb3P09026 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxb3P09026 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxb3P09026 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxb3P09026 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxb3P09026 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxb3P09026 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxb3P09026 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxb3P09026 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxb3P09026 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxb3P09026 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxb3P09026 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxb3P09026 Gm37319-201ENSMUST00000193500 636 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxb3P09026 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxb3P09026 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxb3P09026 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxb3P09026 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxb3P09026 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hoxb3P09026 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hoxb3P09026 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hoxb3P09026 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hoxb3P09026 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hoxb3P09026 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hoxb3P09026 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hoxb3P09026 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hoxb3P09026 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Hoxb3P09026 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hoxb3P09026 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hoxb3P09026 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hoxb3P09026 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hoxb3P09026 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxb3P09026 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxb3P09026 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxb3P09026 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxb3P09026 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxb3P09026 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxb3P09026 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxb3P09026 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxb3P09026 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxb3P09026 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxb3P09026 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxb3P09026 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxb3P09026 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxb3P09026 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxb3P09026 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxb3P09026 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxb3P09026 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxb3P09026 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxb3P09026 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxb3P09026 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxb3P09026 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxb3P09026 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxb3P09026 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxb3P09026 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxb3P09026 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.1 ms