Protein–RNA interactions for Protein: F8VPJ6

Rfx7, Regulatory factor X, 7, mousemouse

Predictions only

Length 1,459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx7F8VPJ6 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rfx7F8VPJ6 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rfx7F8VPJ6 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rfx7F8VPJ6 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rfx7F8VPJ6 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rfx7F8VPJ6 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rfx7F8VPJ6 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rfx7F8VPJ6 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rfx7F8VPJ6 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rfx7F8VPJ6 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rfx7F8VPJ6 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rfx7F8VPJ6 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rfx7F8VPJ6 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rfx7F8VPJ6 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rfx7F8VPJ6 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rfx7F8VPJ6 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rfx7F8VPJ6 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rfx7F8VPJ6 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rfx7F8VPJ6 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Rfx7F8VPJ6 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rfx7F8VPJ6 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rfx7F8VPJ6 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rfx7F8VPJ6 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rfx7F8VPJ6 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rfx7F8VPJ6 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rfx7F8VPJ6 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rfx7F8VPJ6 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rfx7F8VPJ6 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rfx7F8VPJ6 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rfx7F8VPJ6 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rfx7F8VPJ6 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rfx7F8VPJ6 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rfx7F8VPJ6 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rfx7F8VPJ6 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rfx7F8VPJ6 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rfx7F8VPJ6 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rfx7F8VPJ6 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rfx7F8VPJ6 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rfx7F8VPJ6 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rfx7F8VPJ6 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rfx7F8VPJ6 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rfx7F8VPJ6 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rfx7F8VPJ6 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rfx7F8VPJ6 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rfx7F8VPJ6 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Rfx7F8VPJ6 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Rfx7F8VPJ6 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rfx7F8VPJ6 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Rfx7F8VPJ6 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rfx7F8VPJ6 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rfx7F8VPJ6 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rfx7F8VPJ6 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rfx7F8VPJ6 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rfx7F8VPJ6 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rfx7F8VPJ6 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rfx7F8VPJ6 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rfx7F8VPJ6 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rfx7F8VPJ6 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rfx7F8VPJ6 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rfx7F8VPJ6 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rfx7F8VPJ6 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rfx7F8VPJ6 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Rfx7F8VPJ6 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rfx7F8VPJ6 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rfx7F8VPJ6 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rfx7F8VPJ6 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rfx7F8VPJ6 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rfx7F8VPJ6 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rfx7F8VPJ6 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rfx7F8VPJ6 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rfx7F8VPJ6 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rfx7F8VPJ6 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rfx7F8VPJ6 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rfx7F8VPJ6 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rfx7F8VPJ6 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Rfx7F8VPJ6 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Rfx7F8VPJ6 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rfx7F8VPJ6 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rfx7F8VPJ6 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rfx7F8VPJ6 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rfx7F8VPJ6 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rfx7F8VPJ6 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rfx7F8VPJ6 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rfx7F8VPJ6 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rfx7F8VPJ6 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rfx7F8VPJ6 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rfx7F8VPJ6 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rfx7F8VPJ6 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rfx7F8VPJ6 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rfx7F8VPJ6 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rfx7F8VPJ6 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rfx7F8VPJ6 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rfx7F8VPJ6 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rfx7F8VPJ6 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rfx7F8VPJ6 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rfx7F8VPJ6 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Rfx7F8VPJ6 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Rfx7F8VPJ6 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rfx7F8VPJ6 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rfx7F8VPJ6 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms