Protein–RNA interactions for Protein: Q99LD4

Gps1, COP9 signalosome complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gps1Q99LD4 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gps1Q99LD4 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gps1Q99LD4 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gps1Q99LD4 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gps1Q99LD4 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gps1Q99LD4 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gps1Q99LD4 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gps1Q99LD4 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gps1Q99LD4 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gps1Q99LD4 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gps1Q99LD4 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gps1Q99LD4 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gps1Q99LD4 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gps1Q99LD4 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gps1Q99LD4 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gps1Q99LD4 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gps1Q99LD4 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gps1Q99LD4 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gps1Q99LD4 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gps1Q99LD4 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gps1Q99LD4 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gps1Q99LD4 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gps1Q99LD4 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gps1Q99LD4 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gps1Q99LD4 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gps1Q99LD4 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gps1Q99LD4 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gps1Q99LD4 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gps1Q99LD4 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gps1Q99LD4 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gps1Q99LD4 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gps1Q99LD4 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gps1Q99LD4 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gps1Q99LD4 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gps1Q99LD4 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gps1Q99LD4 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gps1Q99LD4 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gps1Q99LD4 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gps1Q99LD4 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gps1Q99LD4 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gps1Q99LD4 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gps1Q99LD4 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gps1Q99LD4 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gps1Q99LD4 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gps1Q99LD4 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gps1Q99LD4 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gps1Q99LD4 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gps1Q99LD4 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gps1Q99LD4 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gps1Q99LD4 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gps1Q99LD4 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gps1Q99LD4 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gps1Q99LD4 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gps1Q99LD4 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gps1Q99LD4 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gps1Q99LD4 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gps1Q99LD4 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gps1Q99LD4 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gps1Q99LD4 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gps1Q99LD4 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gps1Q99LD4 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gps1Q99LD4 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gps1Q99LD4 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gps1Q99LD4 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gps1Q99LD4 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gps1Q99LD4 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gps1Q99LD4 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gps1Q99LD4 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gps1Q99LD4 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gps1Q99LD4 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gps1Q99LD4 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gps1Q99LD4 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gps1Q99LD4 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gps1Q99LD4 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gps1Q99LD4 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gps1Q99LD4 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gps1Q99LD4 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gps1Q99LD4 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gps1Q99LD4 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gps1Q99LD4 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gps1Q99LD4 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gps1Q99LD4 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gps1Q99LD4 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gps1Q99LD4 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gps1Q99LD4 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gps1Q99LD4 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gps1Q99LD4 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gps1Q99LD4 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gps1Q99LD4 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gps1Q99LD4 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gps1Q99LD4 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gps1Q99LD4 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gps1Q99LD4 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gps1Q99LD4 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gps1Q99LD4 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gps1Q99LD4 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gps1Q99LD4 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gps1Q99LD4 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gps1Q99LD4 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gps1Q99LD4 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.1 ms