Protein–RNA interactions for Protein: P09026

Hoxb3, Homeobox protein Hox-B3, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb3P09026 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxb3P09026 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxb3P09026 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxb3P09026 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxb3P09026 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxb3P09026 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxb3P09026 Gm8369-204ENSMUST00000188633 1227 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxb3P09026 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxb3P09026 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxb3P09026 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxb3P09026 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxb3P09026 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxb3P09026 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxb3P09026 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxb3P09026 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxb3P09026 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxb3P09026 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxb3P09026 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxb3P09026 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxb3P09026 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxb3P09026 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxb3P09026 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxb3P09026 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxb3P09026 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxb3P09026 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxb3P09026 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxb3P09026 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxb3P09026 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxb3P09026 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxb3P09026 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxb3P09026 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxb3P09026 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxb3P09026 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxb3P09026 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxb3P09026 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxb3P09026 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxb3P09026 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxb3P09026 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxb3P09026 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxb3P09026 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxb3P09026 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxb3P09026 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxb3P09026 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxb3P09026 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxb3P09026 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxb3P09026 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxb3P09026 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxb3P09026 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxb3P09026 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxb3P09026 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxb3P09026 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxb3P09026 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxb3P09026 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxb3P09026 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxb3P09026 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxb3P09026 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxb3P09026 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxb3P09026 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxb3P09026 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxb3P09026 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxb3P09026 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxb3P09026 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxb3P09026 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxb3P09026 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxb3P09026 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxb3P09026 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxb3P09026 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxb3P09026 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxb3P09026 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxb3P09026 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxb3P09026 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxb3P09026 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxb3P09026 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxb3P09026 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxb3P09026 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxb3P09026 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxb3P09026 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxb3P09026 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxb3P09026 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxb3P09026 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxb3P09026 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxb3P09026 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxb3P09026 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxb3P09026 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxb3P09026 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxb3P09026 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxb3P09026 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxb3P09026 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxb3P09026 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxb3P09026 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxb3P09026 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxb3P09026 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxb3P09026 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxb3P09026 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxb3P09026 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxb3P09026 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxb3P09026 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxb3P09026 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxb3P09026 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxb3P09026 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.1 ms