Protein–RNA interactions for Protein: P09026

Hoxb3, Homeobox protein Hox-B3, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb3P09026 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxb3P09026 Clec4d-201ENSMUST00000032240 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxb3P09026 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxb3P09026 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxb3P09026 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxb3P09026 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxb3P09026 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxb3P09026 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxb3P09026 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxb3P09026 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxb3P09026 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxb3P09026 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxb3P09026 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxb3P09026 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxb3P09026 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxb3P09026 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxb3P09026 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxb3P09026 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxb3P09026 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxb3P09026 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxb3P09026 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxb3P09026 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxb3P09026 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxb3P09026 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxb3P09026 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxb3P09026 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxb3P09026 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxb3P09026 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxb3P09026 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxb3P09026 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxb3P09026 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxb3P09026 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxb3P09026 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxb3P09026 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxb3P09026 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxb3P09026 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxb3P09026 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxb3P09026 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxb3P09026 Gm45251-201ENSMUST00000209486 1465 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxb3P09026 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxb3P09026 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxb3P09026 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxb3P09026 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxb3P09026 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxb3P09026 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxb3P09026 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxb3P09026 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxb3P09026 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxb3P09026 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxb3P09026 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxb3P09026 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxb3P09026 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxb3P09026 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxb3P09026 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxb3P09026 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxb3P09026 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxb3P09026 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxb3P09026 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxb3P09026 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxb3P09026 Gm18515-201ENSMUST00000219755 797 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxb3P09026 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxb3P09026 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxb3P09026 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxb3P09026 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxb3P09026 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxb3P09026 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxb3P09026 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxb3P09026 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hoxb3P09026 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hoxb3P09026 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hoxb3P09026 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hoxb3P09026 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hoxb3P09026 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hoxb3P09026 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Hoxb3P09026 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hoxb3P09026 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxb3P09026 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxb3P09026 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxb3P09026 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxb3P09026 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxb3P09026 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxb3P09026 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxb3P09026 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxb3P09026 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxb3P09026 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxb3P09026 Gm37083-201ENSMUST00000195784 711 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxb3P09026 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxb3P09026 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxb3P09026 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxb3P09026 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxb3P09026 A530030E21Rik-201ENSMUST00000199551 1310 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxb3P09026 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxb3P09026 4930433J02Rik-201ENSMUST00000194719 1386 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxb3P09026 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxb3P09026 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxb3P09026 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxb3P09026 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxb3P09026 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxb3P09026 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxb3P09026 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 164.5 ms