Protein–RNA interactions for Protein: V9GXJ1

Gm28036, Predicted gene, 28036, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28036V9GXJ1 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gm28036V9GXJ1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gm28036V9GXJ1 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gm28036V9GXJ1 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gm28036V9GXJ1 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
Gm28036V9GXJ1 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
Gm28036V9GXJ1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gm28036V9GXJ1 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gm28036V9GXJ1 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Gm28036V9GXJ1 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gm28036V9GXJ1 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gm28036V9GXJ1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gm28036V9GXJ1 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gm28036V9GXJ1 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gm28036V9GXJ1 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gm28036V9GXJ1 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gm28036V9GXJ1 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gm28036V9GXJ1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gm28036V9GXJ1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gm28036V9GXJ1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gm28036V9GXJ1 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gm28036V9GXJ1 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Gm28036V9GXJ1 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Gm28036V9GXJ1 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gm28036V9GXJ1 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gm28036V9GXJ1 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gm28036V9GXJ1 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gm28036V9GXJ1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gm28036V9GXJ1 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gm28036V9GXJ1 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gm28036V9GXJ1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gm28036V9GXJ1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gm28036V9GXJ1 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gm28036V9GXJ1 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gm28036V9GXJ1 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gm28036V9GXJ1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gm28036V9GXJ1 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gm28036V9GXJ1 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gm28036V9GXJ1 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gm28036V9GXJ1 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gm28036V9GXJ1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gm28036V9GXJ1 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Gm28036V9GXJ1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gm28036V9GXJ1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gm28036V9GXJ1 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gm28036V9GXJ1 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Gm28036V9GXJ1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gm28036V9GXJ1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gm28036V9GXJ1 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gm28036V9GXJ1 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gm28036V9GXJ1 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gm28036V9GXJ1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gm28036V9GXJ1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gm28036V9GXJ1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gm28036V9GXJ1 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gm28036V9GXJ1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gm28036V9GXJ1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gm28036V9GXJ1 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gm28036V9GXJ1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gm28036V9GXJ1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gm28036V9GXJ1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gm28036V9GXJ1 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gm28036V9GXJ1 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gm28036V9GXJ1 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gm28036V9GXJ1 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gm28036V9GXJ1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gm28036V9GXJ1 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gm28036V9GXJ1 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Gm28036V9GXJ1 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gm28036V9GXJ1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gm28036V9GXJ1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gm28036V9GXJ1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gm28036V9GXJ1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gm28036V9GXJ1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gm28036V9GXJ1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Gm28036V9GXJ1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Gm28036V9GXJ1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Gm28036V9GXJ1 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Gm28036V9GXJ1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Gm28036V9GXJ1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gm28036V9GXJ1 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gm28036V9GXJ1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gm28036V9GXJ1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gm28036V9GXJ1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gm28036V9GXJ1 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Gm28036V9GXJ1 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gm28036V9GXJ1 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gm28036V9GXJ1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gm28036V9GXJ1 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gm28036V9GXJ1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gm28036V9GXJ1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gm28036V9GXJ1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gm28036V9GXJ1 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Gm28036V9GXJ1 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gm28036V9GXJ1 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gm28036V9GXJ1 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Gm28036V9GXJ1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gm28036V9GXJ1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gm28036V9GXJ1 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gm28036V9GXJ1 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.2 ms