Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2M6

Ubl3, Ubiquitin-like protein 3, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl3Q9Z2M6 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ubl3Q9Z2M6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ubl3Q9Z2M6 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ubl3Q9Z2M6 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ubl3Q9Z2M6 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ubl3Q9Z2M6 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ubl3Q9Z2M6 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ubl3Q9Z2M6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ubl3Q9Z2M6 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ubl3Q9Z2M6 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ubl3Q9Z2M6 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ubl3Q9Z2M6 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ubl3Q9Z2M6 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Ubl3Q9Z2M6 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ubl3Q9Z2M6 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ubl3Q9Z2M6 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Ubl3Q9Z2M6 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ubl3Q9Z2M6 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ubl3Q9Z2M6 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ubl3Q9Z2M6 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ubl3Q9Z2M6 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ubl3Q9Z2M6 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ubl3Q9Z2M6 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ubl3Q9Z2M6 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ubl3Q9Z2M6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ubl3Q9Z2M6 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ubl3Q9Z2M6 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ubl3Q9Z2M6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ubl3Q9Z2M6 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ubl3Q9Z2M6 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ubl3Q9Z2M6 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ubl3Q9Z2M6 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ubl3Q9Z2M6 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ubl3Q9Z2M6 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ubl3Q9Z2M6 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ubl3Q9Z2M6 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ubl3Q9Z2M6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ubl3Q9Z2M6 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ubl3Q9Z2M6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ubl3Q9Z2M6 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ubl3Q9Z2M6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ubl3Q9Z2M6 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ubl3Q9Z2M6 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ubl3Q9Z2M6 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ubl3Q9Z2M6 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ubl3Q9Z2M6 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ubl3Q9Z2M6 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ubl3Q9Z2M6 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Ubl3Q9Z2M6 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ubl3Q9Z2M6 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ubl3Q9Z2M6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ubl3Q9Z2M6 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ubl3Q9Z2M6 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ubl3Q9Z2M6 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Ubl3Q9Z2M6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ubl3Q9Z2M6 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ubl3Q9Z2M6 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ubl3Q9Z2M6 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ubl3Q9Z2M6 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ubl3Q9Z2M6 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Ubl3Q9Z2M6 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Ubl3Q9Z2M6 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Ubl3Q9Z2M6 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ubl3Q9Z2M6 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ubl3Q9Z2M6 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Ubl3Q9Z2M6 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ubl3Q9Z2M6 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ubl3Q9Z2M6 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ubl3Q9Z2M6 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ubl3Q9Z2M6 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ubl3Q9Z2M6 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ubl3Q9Z2M6 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ubl3Q9Z2M6 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ubl3Q9Z2M6 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ubl3Q9Z2M6 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ubl3Q9Z2M6 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ubl3Q9Z2M6 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ubl3Q9Z2M6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ubl3Q9Z2M6 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ubl3Q9Z2M6 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ubl3Q9Z2M6 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ubl3Q9Z2M6 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ubl3Q9Z2M6 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ubl3Q9Z2M6 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ubl3Q9Z2M6 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ubl3Q9Z2M6 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ubl3Q9Z2M6 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ubl3Q9Z2M6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ubl3Q9Z2M6 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ubl3Q9Z2M6 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ubl3Q9Z2M6 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ubl3Q9Z2M6 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ubl3Q9Z2M6 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ubl3Q9Z2M6 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ubl3Q9Z2M6 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ubl3Q9Z2M6 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Ubl3Q9Z2M6 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ubl3Q9Z2M6 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ubl3Q9Z2M6 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ubl3Q9Z2M6 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
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