Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2C6

Upk1b, Uroplakin-1b, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk1bQ9Z2C6 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Upk1bQ9Z2C6 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Upk1bQ9Z2C6 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Upk1bQ9Z2C6 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Upk1bQ9Z2C6 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Upk1bQ9Z2C6 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Upk1bQ9Z2C6 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Upk1bQ9Z2C6 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Upk1bQ9Z2C6 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Upk1bQ9Z2C6 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Upk1bQ9Z2C6 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Upk1bQ9Z2C6 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Upk1bQ9Z2C6 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Upk1bQ9Z2C6 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Upk1bQ9Z2C6 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Upk1bQ9Z2C6 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Upk1bQ9Z2C6 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Upk1bQ9Z2C6 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Upk1bQ9Z2C6 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Upk1bQ9Z2C6 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Upk1bQ9Z2C6 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Upk1bQ9Z2C6 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Upk1bQ9Z2C6 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Upk1bQ9Z2C6 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Upk1bQ9Z2C6 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Upk1bQ9Z2C6 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Upk1bQ9Z2C6 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Upk1bQ9Z2C6 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Upk1bQ9Z2C6 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Upk1bQ9Z2C6 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Upk1bQ9Z2C6 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Upk1bQ9Z2C6 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Upk1bQ9Z2C6 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Upk1bQ9Z2C6 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Upk1bQ9Z2C6 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Upk1bQ9Z2C6 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Upk1bQ9Z2C6 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Upk1bQ9Z2C6 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Upk1bQ9Z2C6 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Upk1bQ9Z2C6 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Upk1bQ9Z2C6 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Upk1bQ9Z2C6 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Upk1bQ9Z2C6 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Upk1bQ9Z2C6 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Upk1bQ9Z2C6 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Upk1bQ9Z2C6 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Upk1bQ9Z2C6 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Upk1bQ9Z2C6 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Upk1bQ9Z2C6 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Upk1bQ9Z2C6 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Upk1bQ9Z2C6 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Upk1bQ9Z2C6 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Upk1bQ9Z2C6 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Upk1bQ9Z2C6 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Upk1bQ9Z2C6 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Upk1bQ9Z2C6 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Upk1bQ9Z2C6 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Upk1bQ9Z2C6 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Upk1bQ9Z2C6 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Upk1bQ9Z2C6 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Upk1bQ9Z2C6 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Upk1bQ9Z2C6 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Upk1bQ9Z2C6 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Upk1bQ9Z2C6 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Upk1bQ9Z2C6 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Upk1bQ9Z2C6 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Upk1bQ9Z2C6 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Upk1bQ9Z2C6 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Upk1bQ9Z2C6 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Upk1bQ9Z2C6 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Upk1bQ9Z2C6 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Upk1bQ9Z2C6 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Upk1bQ9Z2C6 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Upk1bQ9Z2C6 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Upk1bQ9Z2C6 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Upk1bQ9Z2C6 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Upk1bQ9Z2C6 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Upk1bQ9Z2C6 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Upk1bQ9Z2C6 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Upk1bQ9Z2C6 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Upk1bQ9Z2C6 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Upk1bQ9Z2C6 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Upk1bQ9Z2C6 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Upk1bQ9Z2C6 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Upk1bQ9Z2C6 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Upk1bQ9Z2C6 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Upk1bQ9Z2C6 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Upk1bQ9Z2C6 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Upk1bQ9Z2C6 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Upk1bQ9Z2C6 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Upk1bQ9Z2C6 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Upk1bQ9Z2C6 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Upk1bQ9Z2C6 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Upk1bQ9Z2C6 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Upk1bQ9Z2C6 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Upk1bQ9Z2C6 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Upk1bQ9Z2C6 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Upk1bQ9Z2C6 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Upk1bQ9Z2C6 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Upk1bQ9Z2C6 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms