Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z275

Rlbp1, Retinaldehyde-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rlbp1Q9Z275 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rlbp1Q9Z275 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Rlbp1Q9Z275 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Rlbp1Q9Z275 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rlbp1Q9Z275 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rlbp1Q9Z275 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rlbp1Q9Z275 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rlbp1Q9Z275 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rlbp1Q9Z275 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rlbp1Q9Z275 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rlbp1Q9Z275 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Rlbp1Q9Z275 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Rlbp1Q9Z275 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Rlbp1Q9Z275 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Rlbp1Q9Z275 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Rlbp1Q9Z275 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Rlbp1Q9Z275 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Rlbp1Q9Z275 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Rlbp1Q9Z275 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Rlbp1Q9Z275 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rlbp1Q9Z275 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rlbp1Q9Z275 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rlbp1Q9Z275 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Rlbp1Q9Z275 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Rlbp1Q9Z275 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Rlbp1Q9Z275 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Rlbp1Q9Z275 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Rlbp1Q9Z275 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Rlbp1Q9Z275 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Rlbp1Q9Z275 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Rlbp1Q9Z275 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Rlbp1Q9Z275 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Rlbp1Q9Z275 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Rlbp1Q9Z275 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Rlbp1Q9Z275 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Rlbp1Q9Z275 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Rlbp1Q9Z275 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Rlbp1Q9Z275 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Rlbp1Q9Z275 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Rlbp1Q9Z275 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Rlbp1Q9Z275 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
Rlbp1Q9Z275 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Rlbp1Q9Z275 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Rlbp1Q9Z275 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Rlbp1Q9Z275 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Rlbp1Q9Z275 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Rlbp1Q9Z275 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Rlbp1Q9Z275 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Rlbp1Q9Z275 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Rlbp1Q9Z275 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Rlbp1Q9Z275 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Rlbp1Q9Z275 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Rlbp1Q9Z275 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Rlbp1Q9Z275 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Rlbp1Q9Z275 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Rlbp1Q9Z275 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Rlbp1Q9Z275 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Rlbp1Q9Z275 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Rlbp1Q9Z275 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Rlbp1Q9Z275 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Rlbp1Q9Z275 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Rlbp1Q9Z275 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Rlbp1Q9Z275 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Rlbp1Q9Z275 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Rlbp1Q9Z275 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Rlbp1Q9Z275 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Rlbp1Q9Z275 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rlbp1Q9Z275 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rlbp1Q9Z275 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rlbp1Q9Z275 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rlbp1Q9Z275 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rlbp1Q9Z275 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Rlbp1Q9Z275 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Rlbp1Q9Z275 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Rlbp1Q9Z275 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Rlbp1Q9Z275 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Rlbp1Q9Z275 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Rlbp1Q9Z275 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Rlbp1Q9Z275 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Rlbp1Q9Z275 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rlbp1Q9Z275 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Rlbp1Q9Z275 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Rlbp1Q9Z275 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Rlbp1Q9Z275 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rlbp1Q9Z275 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rlbp1Q9Z275 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rlbp1Q9Z275 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rlbp1Q9Z275 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rlbp1Q9Z275 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rlbp1Q9Z275 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rlbp1Q9Z275 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rlbp1Q9Z275 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Rlbp1Q9Z275 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Rlbp1Q9Z275 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Rlbp1Q9Z275 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Rlbp1Q9Z275 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Rlbp1Q9Z275 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rlbp1Q9Z275 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rlbp1Q9Z275 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rlbp1Q9Z275 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms