Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Q5

Clic1, Chloride intracellular channel protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clic1Q9Z1Q5 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Clic1Q9Z1Q5 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Clic1Q9Z1Q5 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Clic1Q9Z1Q5 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Clic1Q9Z1Q5 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Clic1Q9Z1Q5 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Clic1Q9Z1Q5 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Clic1Q9Z1Q5 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Clic1Q9Z1Q5 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Clic1Q9Z1Q5 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Clic1Q9Z1Q5 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Clic1Q9Z1Q5 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Clic1Q9Z1Q5 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Clic1Q9Z1Q5 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Clic1Q9Z1Q5 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Clic1Q9Z1Q5 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Clic1Q9Z1Q5 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Clic1Q9Z1Q5 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Clic1Q9Z1Q5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Clic1Q9Z1Q5 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Clic1Q9Z1Q5 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Clic1Q9Z1Q5 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Clic1Q9Z1Q5 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Clic1Q9Z1Q5 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Clic1Q9Z1Q5 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Clic1Q9Z1Q5 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Clic1Q9Z1Q5 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Clic1Q9Z1Q5 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Clic1Q9Z1Q5 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Clic1Q9Z1Q5 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Clic1Q9Z1Q5 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Clic1Q9Z1Q5 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Clic1Q9Z1Q5 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Clic1Q9Z1Q5 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Clic1Q9Z1Q5 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Clic1Q9Z1Q5 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Clic1Q9Z1Q5 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Clic1Q9Z1Q5 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Clic1Q9Z1Q5 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Clic1Q9Z1Q5 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Clic1Q9Z1Q5 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Clic1Q9Z1Q5 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Clic1Q9Z1Q5 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Clic1Q9Z1Q5 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Clic1Q9Z1Q5 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Clic1Q9Z1Q5 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Clic1Q9Z1Q5 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Clic1Q9Z1Q5 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Clic1Q9Z1Q5 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Clic1Q9Z1Q5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Clic1Q9Z1Q5 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Clic1Q9Z1Q5 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Clic1Q9Z1Q5 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Clic1Q9Z1Q5 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Clic1Q9Z1Q5 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Clic1Q9Z1Q5 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Clic1Q9Z1Q5 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Clic1Q9Z1Q5 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Clic1Q9Z1Q5 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Clic1Q9Z1Q5 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Clic1Q9Z1Q5 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Clic1Q9Z1Q5 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Clic1Q9Z1Q5 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Clic1Q9Z1Q5 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Clic1Q9Z1Q5 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Clic1Q9Z1Q5 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Clic1Q9Z1Q5 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Clic1Q9Z1Q5 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Clic1Q9Z1Q5 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Clic1Q9Z1Q5 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Clic1Q9Z1Q5 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Clic1Q9Z1Q5 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Clic1Q9Z1Q5 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Clic1Q9Z1Q5 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Clic1Q9Z1Q5 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Clic1Q9Z1Q5 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Clic1Q9Z1Q5 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Clic1Q9Z1Q5 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Clic1Q9Z1Q5 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Clic1Q9Z1Q5 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Clic1Q9Z1Q5 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Clic1Q9Z1Q5 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Clic1Q9Z1Q5 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Clic1Q9Z1Q5 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Clic1Q9Z1Q5 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Clic1Q9Z1Q5 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Clic1Q9Z1Q5 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Clic1Q9Z1Q5 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Clic1Q9Z1Q5 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Clic1Q9Z1Q5 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Clic1Q9Z1Q5 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Clic1Q9Z1Q5 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Clic1Q9Z1Q5 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Clic1Q9Z1Q5 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Clic1Q9Z1Q5 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Clic1Q9Z1Q5 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clic1Q9Z1Q5 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clic1Q9Z1Q5 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clic1Q9Z1Q5 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Clic1Q9Z1Q5 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms