Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z140

Cpne6, Copine-6, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne6Q9Z140 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Cpne6Q9Z140 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cpne6Q9Z140 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cpne6Q9Z140 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cpne6Q9Z140 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cpne6Q9Z140 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Cpne6Q9Z140 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cpne6Q9Z140 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cpne6Q9Z140 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cpne6Q9Z140 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cpne6Q9Z140 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cpne6Q9Z140 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cpne6Q9Z140 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Cpne6Q9Z140 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Cpne6Q9Z140 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Cpne6Q9Z140 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cpne6Q9Z140 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cpne6Q9Z140 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cpne6Q9Z140 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cpne6Q9Z140 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cpne6Q9Z140 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cpne6Q9Z140 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cpne6Q9Z140 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cpne6Q9Z140 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cpne6Q9Z140 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cpne6Q9Z140 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cpne6Q9Z140 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cpne6Q9Z140 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cpne6Q9Z140 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cpne6Q9Z140 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cpne6Q9Z140 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cpne6Q9Z140 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cpne6Q9Z140 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cpne6Q9Z140 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cpne6Q9Z140 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Cpne6Q9Z140 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Cpne6Q9Z140 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cpne6Q9Z140 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cpne6Q9Z140 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cpne6Q9Z140 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cpne6Q9Z140 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cpne6Q9Z140 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cpne6Q9Z140 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cpne6Q9Z140 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Cpne6Q9Z140 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cpne6Q9Z140 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cpne6Q9Z140 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cpne6Q9Z140 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cpne6Q9Z140 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Cpne6Q9Z140 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cpne6Q9Z140 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cpne6Q9Z140 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cpne6Q9Z140 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cpne6Q9Z140 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cpne6Q9Z140 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cpne6Q9Z140 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cpne6Q9Z140 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cpne6Q9Z140 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cpne6Q9Z140 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cpne6Q9Z140 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cpne6Q9Z140 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cpne6Q9Z140 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cpne6Q9Z140 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cpne6Q9Z140 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cpne6Q9Z140 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Cpne6Q9Z140 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cpne6Q9Z140 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cpne6Q9Z140 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cpne6Q9Z140 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cpne6Q9Z140 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cpne6Q9Z140 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cpne6Q9Z140 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cpne6Q9Z140 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cpne6Q9Z140 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cpne6Q9Z140 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cpne6Q9Z140 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cpne6Q9Z140 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cpne6Q9Z140 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Cpne6Q9Z140 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cpne6Q9Z140 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cpne6Q9Z140 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cpne6Q9Z140 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cpne6Q9Z140 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cpne6Q9Z140 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cpne6Q9Z140 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cpne6Q9Z140 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cpne6Q9Z140 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cpne6Q9Z140 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cpne6Q9Z140 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cpne6Q9Z140 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cpne6Q9Z140 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cpne6Q9Z140 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cpne6Q9Z140 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cpne6Q9Z140 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cpne6Q9Z140 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Cpne6Q9Z140 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cpne6Q9Z140 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cpne6Q9Z140 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cpne6Q9Z140 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cpne6Q9Z140 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms