Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV85

Nme3, Nucleoside diphosphate kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme3Q9WV85 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Nme3Q9WV85 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nme3Q9WV85 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nme3Q9WV85 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nme3Q9WV85 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nme3Q9WV85 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nme3Q9WV85 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nme3Q9WV85 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nme3Q9WV85 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nme3Q9WV85 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nme3Q9WV85 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nme3Q9WV85 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nme3Q9WV85 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nme3Q9WV85 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nme3Q9WV85 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nme3Q9WV85 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nme3Q9WV85 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nme3Q9WV85 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nme3Q9WV85 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nme3Q9WV85 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nme3Q9WV85 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nme3Q9WV85 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nme3Q9WV85 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nme3Q9WV85 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nme3Q9WV85 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Nme3Q9WV85 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nme3Q9WV85 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nme3Q9WV85 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nme3Q9WV85 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nme3Q9WV85 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Nme3Q9WV85 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Nme3Q9WV85 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nme3Q9WV85 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nme3Q9WV85 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nme3Q9WV85 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nme3Q9WV85 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nme3Q9WV85 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nme3Q9WV85 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nme3Q9WV85 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nme3Q9WV85 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nme3Q9WV85 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Nme3Q9WV85 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nme3Q9WV85 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Nme3Q9WV85 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nme3Q9WV85 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nme3Q9WV85 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nme3Q9WV85 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nme3Q9WV85 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nme3Q9WV85 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nme3Q9WV85 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nme3Q9WV85 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nme3Q9WV85 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nme3Q9WV85 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nme3Q9WV85 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nme3Q9WV85 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nme3Q9WV85 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Nme3Q9WV85 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Nme3Q9WV85 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nme3Q9WV85 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nme3Q9WV85 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nme3Q9WV85 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nme3Q9WV85 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nme3Q9WV85 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nme3Q9WV85 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nme3Q9WV85 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nme3Q9WV85 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Nme3Q9WV85 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nme3Q9WV85 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nme3Q9WV85 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nme3Q9WV85 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nme3Q9WV85 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nme3Q9WV85 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nme3Q9WV85 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nme3Q9WV85 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nme3Q9WV85 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nme3Q9WV85 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nme3Q9WV85 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nme3Q9WV85 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nme3Q9WV85 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nme3Q9WV85 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nme3Q9WV85 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nme3Q9WV85 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nme3Q9WV85 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nme3Q9WV85 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nme3Q9WV85 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nme3Q9WV85 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nme3Q9WV85 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nme3Q9WV85 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Nme3Q9WV85 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nme3Q9WV85 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nme3Q9WV85 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nme3Q9WV85 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nme3Q9WV85 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nme3Q9WV85 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nme3Q9WV85 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Nme3Q9WV85 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nme3Q9WV85 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nme3Q9WV85 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nme3Q9WV85 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nme3Q9WV85 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107.3 ms