Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUK4

Rfc2, Replication factor C subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfc2Q9WUK4 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rfc2Q9WUK4 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rfc2Q9WUK4 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rfc2Q9WUK4 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rfc2Q9WUK4 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rfc2Q9WUK4 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rfc2Q9WUK4 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rfc2Q9WUK4 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rfc2Q9WUK4 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rfc2Q9WUK4 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rfc2Q9WUK4 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rfc2Q9WUK4 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rfc2Q9WUK4 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rfc2Q9WUK4 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rfc2Q9WUK4 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rfc2Q9WUK4 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rfc2Q9WUK4 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rfc2Q9WUK4 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rfc2Q9WUK4 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rfc2Q9WUK4 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rfc2Q9WUK4 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rfc2Q9WUK4 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Rfc2Q9WUK4 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rfc2Q9WUK4 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rfc2Q9WUK4 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rfc2Q9WUK4 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rfc2Q9WUK4 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rfc2Q9WUK4 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rfc2Q9WUK4 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rfc2Q9WUK4 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rfc2Q9WUK4 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rfc2Q9WUK4 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rfc2Q9WUK4 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rfc2Q9WUK4 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rfc2Q9WUK4 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rfc2Q9WUK4 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rfc2Q9WUK4 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rfc2Q9WUK4 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rfc2Q9WUK4 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rfc2Q9WUK4 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rfc2Q9WUK4 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rfc2Q9WUK4 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rfc2Q9WUK4 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rfc2Q9WUK4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rfc2Q9WUK4 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rfc2Q9WUK4 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Rfc2Q9WUK4 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rfc2Q9WUK4 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Rfc2Q9WUK4 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rfc2Q9WUK4 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rfc2Q9WUK4 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rfc2Q9WUK4 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rfc2Q9WUK4 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rfc2Q9WUK4 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rfc2Q9WUK4 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rfc2Q9WUK4 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rfc2Q9WUK4 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rfc2Q9WUK4 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rfc2Q9WUK4 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rfc2Q9WUK4 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Rfc2Q9WUK4 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rfc2Q9WUK4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rfc2Q9WUK4 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rfc2Q9WUK4 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rfc2Q9WUK4 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rfc2Q9WUK4 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rfc2Q9WUK4 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Rfc2Q9WUK4 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rfc2Q9WUK4 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rfc2Q9WUK4 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Rfc2Q9WUK4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Rfc2Q9WUK4 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rfc2Q9WUK4 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rfc2Q9WUK4 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Rfc2Q9WUK4 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Rfc2Q9WUK4 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Rfc2Q9WUK4 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Rfc2Q9WUK4 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rfc2Q9WUK4 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rfc2Q9WUK4 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rfc2Q9WUK4 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rfc2Q9WUK4 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Rfc2Q9WUK4 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rfc2Q9WUK4 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rfc2Q9WUK4 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rfc2Q9WUK4 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Rfc2Q9WUK4 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rfc2Q9WUK4 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rfc2Q9WUK4 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rfc2Q9WUK4 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rfc2Q9WUK4 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rfc2Q9WUK4 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rfc2Q9WUK4 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rfc2Q9WUK4 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rfc2Q9WUK4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rfc2Q9WUK4 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rfc2Q9WUK4 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rfc2Q9WUK4 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rfc2Q9WUK4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rfc2Q9WUK4 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms