Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUH5

Trim10, Tripartite motif-containing protein 10, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim10Q9WUH5 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trim10Q9WUH5 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trim10Q9WUH5 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Trim10Q9WUH5 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trim10Q9WUH5 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trim10Q9WUH5 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trim10Q9WUH5 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trim10Q9WUH5 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trim10Q9WUH5 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trim10Q9WUH5 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trim10Q9WUH5 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trim10Q9WUH5 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trim10Q9WUH5 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trim10Q9WUH5 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trim10Q9WUH5 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trim10Q9WUH5 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trim10Q9WUH5 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trim10Q9WUH5 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trim10Q9WUH5 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Trim10Q9WUH5 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trim10Q9WUH5 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trim10Q9WUH5 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trim10Q9WUH5 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trim10Q9WUH5 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trim10Q9WUH5 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trim10Q9WUH5 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trim10Q9WUH5 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trim10Q9WUH5 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trim10Q9WUH5 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trim10Q9WUH5 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim10Q9WUH5 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim10Q9WUH5 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim10Q9WUH5 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim10Q9WUH5 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim10Q9WUH5 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim10Q9WUH5 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim10Q9WUH5 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim10Q9WUH5 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim10Q9WUH5 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim10Q9WUH5 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim10Q9WUH5 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim10Q9WUH5 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim10Q9WUH5 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim10Q9WUH5 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim10Q9WUH5 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim10Q9WUH5 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim10Q9WUH5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trim10Q9WUH5 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trim10Q9WUH5 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trim10Q9WUH5 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trim10Q9WUH5 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trim10Q9WUH5 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trim10Q9WUH5 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trim10Q9WUH5 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trim10Q9WUH5 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trim10Q9WUH5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trim10Q9WUH5 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Trim10Q9WUH5 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Trim10Q9WUH5 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trim10Q9WUH5 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trim10Q9WUH5 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trim10Q9WUH5 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trim10Q9WUH5 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim10Q9WUH5 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim10Q9WUH5 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim10Q9WUH5 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim10Q9WUH5 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim10Q9WUH5 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trim10Q9WUH5 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trim10Q9WUH5 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trim10Q9WUH5 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trim10Q9WUH5 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trim10Q9WUH5 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Trim10Q9WUH5 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trim10Q9WUH5 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trim10Q9WUH5 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim10Q9WUH5 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Trim10Q9WUH5 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Trim10Q9WUH5 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim10Q9WUH5 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim10Q9WUH5 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim10Q9WUH5 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim10Q9WUH5 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim10Q9WUH5 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim10Q9WUH5 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim10Q9WUH5 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim10Q9WUH5 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trim10Q9WUH5 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trim10Q9WUH5 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim10Q9WUH5 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim10Q9WUH5 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim10Q9WUH5 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trim10Q9WUH5 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trim10Q9WUH5 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trim10Q9WUH5 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trim10Q9WUH5 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trim10Q9WUH5 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trim10Q9WUH5 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trim10Q9WUH5 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trim10Q9WUH5 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms