Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUH2

Lhx9, LIM/homeobox protein Lhx9, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx9Q9WUH2 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Lhx9Q9WUH2 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lhx9Q9WUH2 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lhx9Q9WUH2 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Lhx9Q9WUH2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lhx9Q9WUH2 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Lhx9Q9WUH2 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Lhx9Q9WUH2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lhx9Q9WUH2 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lhx9Q9WUH2 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lhx9Q9WUH2 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lhx9Q9WUH2 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Lhx9Q9WUH2 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lhx9Q9WUH2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lhx9Q9WUH2 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Lhx9Q9WUH2 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lhx9Q9WUH2 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lhx9Q9WUH2 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lhx9Q9WUH2 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lhx9Q9WUH2 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lhx9Q9WUH2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lhx9Q9WUH2 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lhx9Q9WUH2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lhx9Q9WUH2 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lhx9Q9WUH2 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lhx9Q9WUH2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lhx9Q9WUH2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lhx9Q9WUH2 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lhx9Q9WUH2 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lhx9Q9WUH2 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lhx9Q9WUH2 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lhx9Q9WUH2 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lhx9Q9WUH2 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lhx9Q9WUH2 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lhx9Q9WUH2 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lhx9Q9WUH2 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lhx9Q9WUH2 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lhx9Q9WUH2 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lhx9Q9WUH2 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lhx9Q9WUH2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lhx9Q9WUH2 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lhx9Q9WUH2 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lhx9Q9WUH2 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lhx9Q9WUH2 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lhx9Q9WUH2 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lhx9Q9WUH2 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lhx9Q9WUH2 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Lhx9Q9WUH2 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lhx9Q9WUH2 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lhx9Q9WUH2 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lhx9Q9WUH2 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lhx9Q9WUH2 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lhx9Q9WUH2 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lhx9Q9WUH2 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lhx9Q9WUH2 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lhx9Q9WUH2 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Lhx9Q9WUH2 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lhx9Q9WUH2 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lhx9Q9WUH2 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lhx9Q9WUH2 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lhx9Q9WUH2 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lhx9Q9WUH2 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lhx9Q9WUH2 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Lhx9Q9WUH2 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lhx9Q9WUH2 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lhx9Q9WUH2 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lhx9Q9WUH2 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lhx9Q9WUH2 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lhx9Q9WUH2 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lhx9Q9WUH2 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Lhx9Q9WUH2 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lhx9Q9WUH2 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lhx9Q9WUH2 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Lhx9Q9WUH2 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Lhx9Q9WUH2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lhx9Q9WUH2 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Lhx9Q9WUH2 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lhx9Q9WUH2 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lhx9Q9WUH2 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lhx9Q9WUH2 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lhx9Q9WUH2 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lhx9Q9WUH2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lhx9Q9WUH2 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lhx9Q9WUH2 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lhx9Q9WUH2 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lhx9Q9WUH2 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lhx9Q9WUH2 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lhx9Q9WUH2 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Lhx9Q9WUH2 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lhx9Q9WUH2 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Lhx9Q9WUH2 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lhx9Q9WUH2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lhx9Q9WUH2 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lhx9Q9WUH2 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lhx9Q9WUH2 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lhx9Q9WUH2 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lhx9Q9WUH2 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lhx9Q9WUH2 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lhx9Q9WUH2 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lhx9Q9WUH2 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms