Protein–RNA interactions for Protein: Q9R069

Bcam, Basal cell adhesion molecule, mousemouse

Predictions only

Length 622 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BcamQ9R069 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
BcamQ9R069 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BcamQ9R069 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BcamQ9R069 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BcamQ9R069 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BcamQ9R069 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
BcamQ9R069 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
BcamQ9R069 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BcamQ9R069 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BcamQ9R069 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BcamQ9R069 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BcamQ9R069 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BcamQ9R069 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BcamQ9R069 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BcamQ9R069 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
BcamQ9R069 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BcamQ9R069 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BcamQ9R069 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
BcamQ9R069 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BcamQ9R069 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BcamQ9R069 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BcamQ9R069 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BcamQ9R069 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BcamQ9R069 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BcamQ9R069 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
BcamQ9R069 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
BcamQ9R069 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
BcamQ9R069 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
BcamQ9R069 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
BcamQ9R069 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
BcamQ9R069 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BcamQ9R069 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
BcamQ9R069 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BcamQ9R069 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BcamQ9R069 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BcamQ9R069 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BcamQ9R069 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BcamQ9R069 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BcamQ9R069 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BcamQ9R069 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BcamQ9R069 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BcamQ9R069 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BcamQ9R069 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BcamQ9R069 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
BcamQ9R069 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BcamQ9R069 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BcamQ9R069 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BcamQ9R069 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BcamQ9R069 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BcamQ9R069 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BcamQ9R069 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
BcamQ9R069 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BcamQ9R069 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BcamQ9R069 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
BcamQ9R069 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
BcamQ9R069 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
BcamQ9R069 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BcamQ9R069 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BcamQ9R069 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
BcamQ9R069 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
BcamQ9R069 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BcamQ9R069 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BcamQ9R069 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
BcamQ9R069 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
BcamQ9R069 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
BcamQ9R069 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
BcamQ9R069 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
BcamQ9R069 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
BcamQ9R069 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
BcamQ9R069 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BcamQ9R069 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BcamQ9R069 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BcamQ9R069 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BcamQ9R069 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BcamQ9R069 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BcamQ9R069 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BcamQ9R069 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BcamQ9R069 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
BcamQ9R069 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
BcamQ9R069 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BcamQ9R069 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BcamQ9R069 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BcamQ9R069 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BcamQ9R069 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BcamQ9R069 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BcamQ9R069 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BcamQ9R069 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
BcamQ9R069 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BcamQ9R069 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BcamQ9R069 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BcamQ9R069 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BcamQ9R069 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BcamQ9R069 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BcamQ9R069 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BcamQ9R069 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BcamQ9R069 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BcamQ9R069 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BcamQ9R069 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BcamQ9R069 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BcamQ9R069 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms