Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS7

Nphs1, Nephrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphs1Q9QZS7 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nphs1Q9QZS7 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nphs1Q9QZS7 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nphs1Q9QZS7 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nphs1Q9QZS7 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nphs1Q9QZS7 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nphs1Q9QZS7 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nphs1Q9QZS7 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nphs1Q9QZS7 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Nphs1Q9QZS7 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Nphs1Q9QZS7 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nphs1Q9QZS7 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nphs1Q9QZS7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nphs1Q9QZS7 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nphs1Q9QZS7 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nphs1Q9QZS7 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nphs1Q9QZS7 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nphs1Q9QZS7 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nphs1Q9QZS7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nphs1Q9QZS7 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nphs1Q9QZS7 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Nphs1Q9QZS7 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Nphs1Q9QZS7 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nphs1Q9QZS7 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Nphs1Q9QZS7 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Nphs1Q9QZS7 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nphs1Q9QZS7 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nphs1Q9QZS7 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Nphs1Q9QZS7 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nphs1Q9QZS7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nphs1Q9QZS7 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nphs1Q9QZS7 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nphs1Q9QZS7 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nphs1Q9QZS7 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nphs1Q9QZS7 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nphs1Q9QZS7 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nphs1Q9QZS7 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nphs1Q9QZS7 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nphs1Q9QZS7 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nphs1Q9QZS7 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Nphs1Q9QZS7 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nphs1Q9QZS7 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nphs1Q9QZS7 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nphs1Q9QZS7 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nphs1Q9QZS7 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nphs1Q9QZS7 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nphs1Q9QZS7 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Nphs1Q9QZS7 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nphs1Q9QZS7 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nphs1Q9QZS7 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nphs1Q9QZS7 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nphs1Q9QZS7 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nphs1Q9QZS7 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nphs1Q9QZS7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nphs1Q9QZS7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nphs1Q9QZS7 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nphs1Q9QZS7 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nphs1Q9QZS7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nphs1Q9QZS7 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nphs1Q9QZS7 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Nphs1Q9QZS7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nphs1Q9QZS7 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nphs1Q9QZS7 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nphs1Q9QZS7 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nphs1Q9QZS7 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nphs1Q9QZS7 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nphs1Q9QZS7 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Nphs1Q9QZS7 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nphs1Q9QZS7 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nphs1Q9QZS7 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Nphs1Q9QZS7 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nphs1Q9QZS7 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nphs1Q9QZS7 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nphs1Q9QZS7 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nphs1Q9QZS7 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nphs1Q9QZS7 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nphs1Q9QZS7 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nphs1Q9QZS7 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nphs1Q9QZS7 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nphs1Q9QZS7 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nphs1Q9QZS7 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nphs1Q9QZS7 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nphs1Q9QZS7 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nphs1Q9QZS7 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nphs1Q9QZS7 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nphs1Q9QZS7 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nphs1Q9QZS7 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nphs1Q9QZS7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nphs1Q9QZS7 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nphs1Q9QZS7 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nphs1Q9QZS7 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nphs1Q9QZS7 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nphs1Q9QZS7 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nphs1Q9QZS7 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nphs1Q9QZS7 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nphs1Q9QZS7 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nphs1Q9QZS7 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nphs1Q9QZS7 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nphs1Q9QZS7 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Nphs1Q9QZS7 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms