Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYF1

Rdh11, Retinol dehydrogenase 11, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh11Q9QYF1 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Rdh11Q9QYF1 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rdh11Q9QYF1 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rdh11Q9QYF1 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Rdh11Q9QYF1 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Rdh11Q9QYF1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rdh11Q9QYF1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rdh11Q9QYF1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rdh11Q9QYF1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rdh11Q9QYF1 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rdh11Q9QYF1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rdh11Q9QYF1 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rdh11Q9QYF1 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rdh11Q9QYF1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rdh11Q9QYF1 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rdh11Q9QYF1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rdh11Q9QYF1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rdh11Q9QYF1 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rdh11Q9QYF1 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rdh11Q9QYF1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rdh11Q9QYF1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rdh11Q9QYF1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rdh11Q9QYF1 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rdh11Q9QYF1 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Rdh11Q9QYF1 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rdh11Q9QYF1 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rdh11Q9QYF1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rdh11Q9QYF1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rdh11Q9QYF1 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rdh11Q9QYF1 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rdh11Q9QYF1 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rdh11Q9QYF1 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rdh11Q9QYF1 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rdh11Q9QYF1 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rdh11Q9QYF1 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rdh11Q9QYF1 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rdh11Q9QYF1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rdh11Q9QYF1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rdh11Q9QYF1 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Rdh11Q9QYF1 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rdh11Q9QYF1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rdh11Q9QYF1 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rdh11Q9QYF1 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rdh11Q9QYF1 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rdh11Q9QYF1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rdh11Q9QYF1 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rdh11Q9QYF1 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rdh11Q9QYF1 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rdh11Q9QYF1 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Rdh11Q9QYF1 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Rdh11Q9QYF1 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rdh11Q9QYF1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rdh11Q9QYF1 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rdh11Q9QYF1 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rdh11Q9QYF1 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rdh11Q9QYF1 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rdh11Q9QYF1 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rdh11Q9QYF1 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rdh11Q9QYF1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rdh11Q9QYF1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rdh11Q9QYF1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rdh11Q9QYF1 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rdh11Q9QYF1 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rdh11Q9QYF1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rdh11Q9QYF1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rdh11Q9QYF1 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rdh11Q9QYF1 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rdh11Q9QYF1 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Rdh11Q9QYF1 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rdh11Q9QYF1 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rdh11Q9QYF1 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rdh11Q9QYF1 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rdh11Q9QYF1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rdh11Q9QYF1 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rdh11Q9QYF1 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rdh11Q9QYF1 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Rdh11Q9QYF1 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Rdh11Q9QYF1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rdh11Q9QYF1 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rdh11Q9QYF1 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Rdh11Q9QYF1 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Rdh11Q9QYF1 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rdh11Q9QYF1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rdh11Q9QYF1 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rdh11Q9QYF1 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rdh11Q9QYF1 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rdh11Q9QYF1 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rdh11Q9QYF1 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rdh11Q9QYF1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rdh11Q9QYF1 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rdh11Q9QYF1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rdh11Q9QYF1 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rdh11Q9QYF1 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rdh11Q9QYF1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rdh11Q9QYF1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rdh11Q9QYF1 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rdh11Q9QYF1 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rdh11Q9QYF1 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rdh11Q9QYF1 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rdh11Q9QYF1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms