Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWT9

Kifc1, Kinesin-like protein KIFC1, mousemouse

Predictions only

Length 674 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kifc1Q9QWT9 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kifc1Q9QWT9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kifc1Q9QWT9 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Kifc1Q9QWT9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Kifc1Q9QWT9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Kifc1Q9QWT9 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Kifc1Q9QWT9 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Kifc1Q9QWT9 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Kifc1Q9QWT9 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Kifc1Q9QWT9 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Kifc1Q9QWT9 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Kifc1Q9QWT9 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Kifc1Q9QWT9 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Kifc1Q9QWT9 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Kifc1Q9QWT9 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Kifc1Q9QWT9 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Kifc1Q9QWT9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Kifc1Q9QWT9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Kifc1Q9QWT9 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Kifc1Q9QWT9 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Kifc1Q9QWT9 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Kifc1Q9QWT9 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Kifc1Q9QWT9 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Kifc1Q9QWT9 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Kifc1Q9QWT9 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Kifc1Q9QWT9 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Kifc1Q9QWT9 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Kifc1Q9QWT9 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Kifc1Q9QWT9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Kifc1Q9QWT9 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Kifc1Q9QWT9 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Kifc1Q9QWT9 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Kifc1Q9QWT9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Kifc1Q9QWT9 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Kifc1Q9QWT9 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Kifc1Q9QWT9 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Kifc1Q9QWT9 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Kifc1Q9QWT9 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Kifc1Q9QWT9 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Kifc1Q9QWT9 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Kifc1Q9QWT9 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Kifc1Q9QWT9 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Kifc1Q9QWT9 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Kifc1Q9QWT9 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Kifc1Q9QWT9 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Kifc1Q9QWT9 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Kifc1Q9QWT9 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Kifc1Q9QWT9 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Kifc1Q9QWT9 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Kifc1Q9QWT9 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Kifc1Q9QWT9 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Kifc1Q9QWT9 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Kifc1Q9QWT9 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Kifc1Q9QWT9 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Kifc1Q9QWT9 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Kifc1Q9QWT9 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Kifc1Q9QWT9 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Kifc1Q9QWT9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Kifc1Q9QWT9 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Kifc1Q9QWT9 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Kifc1Q9QWT9 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Kifc1Q9QWT9 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Kifc1Q9QWT9 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Kifc1Q9QWT9 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Kifc1Q9QWT9 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Kifc1Q9QWT9 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Kifc1Q9QWT9 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Kifc1Q9QWT9 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Kifc1Q9QWT9 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Kifc1Q9QWT9 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Kifc1Q9QWT9 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Kifc1Q9QWT9 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Kifc1Q9QWT9 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Kifc1Q9QWT9 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Kifc1Q9QWT9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Kifc1Q9QWT9 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Kifc1Q9QWT9 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Kifc1Q9QWT9 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Kifc1Q9QWT9 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Kifc1Q9QWT9 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Kifc1Q9QWT9 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Kifc1Q9QWT9 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Kifc1Q9QWT9 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Kifc1Q9QWT9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Kifc1Q9QWT9 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Kifc1Q9QWT9 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Kifc1Q9QWT9 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Kifc1Q9QWT9 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Kifc1Q9QWT9 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Kifc1Q9QWT9 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Kifc1Q9QWT9 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kifc1Q9QWT9 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kifc1Q9QWT9 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kifc1Q9QWT9 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kifc1Q9QWT9 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kifc1Q9QWT9 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kifc1Q9QWT9 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kifc1Q9QWT9 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kifc1Q9QWT9 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kifc1Q9QWT9 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms