Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL96

Ctsm, Cathepsin M, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsmQ9JL96 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CtsmQ9JL96 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CtsmQ9JL96 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CtsmQ9JL96 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CtsmQ9JL96 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CtsmQ9JL96 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CtsmQ9JL96 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CtsmQ9JL96 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CtsmQ9JL96 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CtsmQ9JL96 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CtsmQ9JL96 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CtsmQ9JL96 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CtsmQ9JL96 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CtsmQ9JL96 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CtsmQ9JL96 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CtsmQ9JL96 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CtsmQ9JL96 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CtsmQ9JL96 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CtsmQ9JL96 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CtsmQ9JL96 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CtsmQ9JL96 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CtsmQ9JL96 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CtsmQ9JL96 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CtsmQ9JL96 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CtsmQ9JL96 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CtsmQ9JL96 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CtsmQ9JL96 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CtsmQ9JL96 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CtsmQ9JL96 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CtsmQ9JL96 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CtsmQ9JL96 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CtsmQ9JL96 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CtsmQ9JL96 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CtsmQ9JL96 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CtsmQ9JL96 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CtsmQ9JL96 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CtsmQ9JL96 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CtsmQ9JL96 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CtsmQ9JL96 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CtsmQ9JL96 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CtsmQ9JL96 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CtsmQ9JL96 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CtsmQ9JL96 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CtsmQ9JL96 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CtsmQ9JL96 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CtsmQ9JL96 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CtsmQ9JL96 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CtsmQ9JL96 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CtsmQ9JL96 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CtsmQ9JL96 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CtsmQ9JL96 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CtsmQ9JL96 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CtsmQ9JL96 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CtsmQ9JL96 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CtsmQ9JL96 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CtsmQ9JL96 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CtsmQ9JL96 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CtsmQ9JL96 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CtsmQ9JL96 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CtsmQ9JL96 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CtsmQ9JL96 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CtsmQ9JL96 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CtsmQ9JL96 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CtsmQ9JL96 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CtsmQ9JL96 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CtsmQ9JL96 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CtsmQ9JL96 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CtsmQ9JL96 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CtsmQ9JL96 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CtsmQ9JL96 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CtsmQ9JL96 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CtsmQ9JL96 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CtsmQ9JL96 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CtsmQ9JL96 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CtsmQ9JL96 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CtsmQ9JL96 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CtsmQ9JL96 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CtsmQ9JL96 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CtsmQ9JL96 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CtsmQ9JL96 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CtsmQ9JL96 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CtsmQ9JL96 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CtsmQ9JL96 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CtsmQ9JL96 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CtsmQ9JL96 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CtsmQ9JL96 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CtsmQ9JL96 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CtsmQ9JL96 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CtsmQ9JL96 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CtsmQ9JL96 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CtsmQ9JL96 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CtsmQ9JL96 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CtsmQ9JL96 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CtsmQ9JL96 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CtsmQ9JL96 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CtsmQ9JL96 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CtsmQ9JL96 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CtsmQ9JL96 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CtsmQ9JL96 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CtsmQ9JL96 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms