Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL35

Hmgn5, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn5Q9JL35 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Hmgn5Q9JL35 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Hmgn5Q9JL35 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Hmgn5Q9JL35 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Hmgn5Q9JL35 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Hmgn5Q9JL35 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Hmgn5Q9JL35 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Hmgn5Q9JL35 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Hmgn5Q9JL35 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Hmgn5Q9JL35 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Hmgn5Q9JL35 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Hmgn5Q9JL35 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Hmgn5Q9JL35 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Hmgn5Q9JL35 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Hmgn5Q9JL35 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Hmgn5Q9JL35 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Hmgn5Q9JL35 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Hmgn5Q9JL35 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Hmgn5Q9JL35 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Hmgn5Q9JL35 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Hmgn5Q9JL35 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Hmgn5Q9JL35 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Hmgn5Q9JL35 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Hmgn5Q9JL35 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Hmgn5Q9JL35 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Hmgn5Q9JL35 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Hmgn5Q9JL35 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Hmgn5Q9JL35 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Hmgn5Q9JL35 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Hmgn5Q9JL35 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Hmgn5Q9JL35 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Hmgn5Q9JL35 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Hmgn5Q9JL35 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Hmgn5Q9JL35 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Hmgn5Q9JL35 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Hmgn5Q9JL35 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Hmgn5Q9JL35 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Hmgn5Q9JL35 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Hmgn5Q9JL35 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Hmgn5Q9JL35 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Hmgn5Q9JL35 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Hmgn5Q9JL35 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Hmgn5Q9JL35 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Hmgn5Q9JL35 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Hmgn5Q9JL35 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Hmgn5Q9JL35 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Hmgn5Q9JL35 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Hmgn5Q9JL35 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Hmgn5Q9JL35 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Hmgn5Q9JL35 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Hmgn5Q9JL35 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Hmgn5Q9JL35 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Hmgn5Q9JL35 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Hmgn5Q9JL35 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Hmgn5Q9JL35 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Hmgn5Q9JL35 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Hmgn5Q9JL35 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Hmgn5Q9JL35 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Hmgn5Q9JL35 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Hmgn5Q9JL35 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Hmgn5Q9JL35 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Hmgn5Q9JL35 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Hmgn5Q9JL35 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Hmgn5Q9JL35 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Hmgn5Q9JL35 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Hmgn5Q9JL35 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Hmgn5Q9JL35 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Hmgn5Q9JL35 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Hmgn5Q9JL35 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Hmgn5Q9JL35 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Hmgn5Q9JL35 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Hmgn5Q9JL35 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Hmgn5Q9JL35 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Hmgn5Q9JL35 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Hmgn5Q9JL35 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Hmgn5Q9JL35 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Hmgn5Q9JL35 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Hmgn5Q9JL35 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Hmgn5Q9JL35 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Hmgn5Q9JL35 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Hmgn5Q9JL35 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Hmgn5Q9JL35 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Hmgn5Q9JL35 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Hmgn5Q9JL35 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Hmgn5Q9JL35 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Hmgn5Q9JL35 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Hmgn5Q9JL35 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Hmgn5Q9JL35 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Hmgn5Q9JL35 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Hmgn5Q9JL35 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Hmgn5Q9JL35 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Hmgn5Q9JL35 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Hmgn5Q9JL35 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Hmgn5Q9JL35 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Hmgn5Q9JL35 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Hmgn5Q9JL35 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Hmgn5Q9JL35 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Hmgn5Q9JL35 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Hmgn5Q9JL35 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Hmgn5Q9JL35 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 123.5 ms