Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKU8

Lmx1a, LIM homeobox transcription factor 1-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmx1aQ9JKU8 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lmx1aQ9JKU8 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lmx1aQ9JKU8 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lmx1aQ9JKU8 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lmx1aQ9JKU8 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lmx1aQ9JKU8 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lmx1aQ9JKU8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Lmx1aQ9JKU8 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Lmx1aQ9JKU8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lmx1aQ9JKU8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lmx1aQ9JKU8 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lmx1aQ9JKU8 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lmx1aQ9JKU8 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lmx1aQ9JKU8 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lmx1aQ9JKU8 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lmx1aQ9JKU8 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lmx1aQ9JKU8 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lmx1aQ9JKU8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lmx1aQ9JKU8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lmx1aQ9JKU8 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Lmx1aQ9JKU8 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Lmx1aQ9JKU8 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lmx1aQ9JKU8 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lmx1aQ9JKU8 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Lmx1aQ9JKU8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lmx1aQ9JKU8 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lmx1aQ9JKU8 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lmx1aQ9JKU8 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lmx1aQ9JKU8 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lmx1aQ9JKU8 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lmx1aQ9JKU8 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lmx1aQ9JKU8 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lmx1aQ9JKU8 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lmx1aQ9JKU8 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lmx1aQ9JKU8 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lmx1aQ9JKU8 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lmx1aQ9JKU8 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lmx1aQ9JKU8 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lmx1aQ9JKU8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lmx1aQ9JKU8 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lmx1aQ9JKU8 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lmx1aQ9JKU8 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lmx1aQ9JKU8 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lmx1aQ9JKU8 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Lmx1aQ9JKU8 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lmx1aQ9JKU8 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lmx1aQ9JKU8 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lmx1aQ9JKU8 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lmx1aQ9JKU8 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lmx1aQ9JKU8 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lmx1aQ9JKU8 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lmx1aQ9JKU8 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lmx1aQ9JKU8 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lmx1aQ9JKU8 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lmx1aQ9JKU8 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Lmx1aQ9JKU8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lmx1aQ9JKU8 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lmx1aQ9JKU8 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Lmx1aQ9JKU8 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lmx1aQ9JKU8 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Lmx1aQ9JKU8 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lmx1aQ9JKU8 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lmx1aQ9JKU8 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Lmx1aQ9JKU8 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lmx1aQ9JKU8 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lmx1aQ9JKU8 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lmx1aQ9JKU8 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lmx1aQ9JKU8 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lmx1aQ9JKU8 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lmx1aQ9JKU8 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lmx1aQ9JKU8 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lmx1aQ9JKU8 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lmx1aQ9JKU8 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lmx1aQ9JKU8 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Lmx1aQ9JKU8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lmx1aQ9JKU8 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lmx1aQ9JKU8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lmx1aQ9JKU8 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lmx1aQ9JKU8 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lmx1aQ9JKU8 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lmx1aQ9JKU8 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Lmx1aQ9JKU8 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lmx1aQ9JKU8 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lmx1aQ9JKU8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lmx1aQ9JKU8 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lmx1aQ9JKU8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lmx1aQ9JKU8 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lmx1aQ9JKU8 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lmx1aQ9JKU8 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lmx1aQ9JKU8 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lmx1aQ9JKU8 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lmx1aQ9JKU8 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Lmx1aQ9JKU8 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lmx1aQ9JKU8 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lmx1aQ9JKU8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lmx1aQ9JKU8 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lmx1aQ9JKU8 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lmx1aQ9JKU8 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lmx1aQ9JKU8 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lmx1aQ9JKU8 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.1 ms