Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ9

Cngb3, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cngb3Q9JJZ9 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cngb3Q9JJZ9 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cngb3Q9JJZ9 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cngb3Q9JJZ9 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cngb3Q9JJZ9 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cngb3Q9JJZ9 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cngb3Q9JJZ9 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cngb3Q9JJZ9 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cngb3Q9JJZ9 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cngb3Q9JJZ9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cngb3Q9JJZ9 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cngb3Q9JJZ9 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cngb3Q9JJZ9 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cngb3Q9JJZ9 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cngb3Q9JJZ9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cngb3Q9JJZ9 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cngb3Q9JJZ9 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cngb3Q9JJZ9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cngb3Q9JJZ9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cngb3Q9JJZ9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cngb3Q9JJZ9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cngb3Q9JJZ9 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cngb3Q9JJZ9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cngb3Q9JJZ9 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cngb3Q9JJZ9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cngb3Q9JJZ9 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cngb3Q9JJZ9 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cngb3Q9JJZ9 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cngb3Q9JJZ9 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cngb3Q9JJZ9 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cngb3Q9JJZ9 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cngb3Q9JJZ9 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cngb3Q9JJZ9 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cngb3Q9JJZ9 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Cngb3Q9JJZ9 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cngb3Q9JJZ9 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cngb3Q9JJZ9 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cngb3Q9JJZ9 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cngb3Q9JJZ9 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cngb3Q9JJZ9 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cngb3Q9JJZ9 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cngb3Q9JJZ9 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Cngb3Q9JJZ9 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cngb3Q9JJZ9 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Cngb3Q9JJZ9 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cngb3Q9JJZ9 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cngb3Q9JJZ9 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cngb3Q9JJZ9 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cngb3Q9JJZ9 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cngb3Q9JJZ9 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cngb3Q9JJZ9 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cngb3Q9JJZ9 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cngb3Q9JJZ9 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cngb3Q9JJZ9 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cngb3Q9JJZ9 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cngb3Q9JJZ9 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Cngb3Q9JJZ9 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cngb3Q9JJZ9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cngb3Q9JJZ9 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cngb3Q9JJZ9 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cngb3Q9JJZ9 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cngb3Q9JJZ9 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cngb3Q9JJZ9 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cngb3Q9JJZ9 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cngb3Q9JJZ9 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cngb3Q9JJZ9 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cngb3Q9JJZ9 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cngb3Q9JJZ9 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cngb3Q9JJZ9 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cngb3Q9JJZ9 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cngb3Q9JJZ9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cngb3Q9JJZ9 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cngb3Q9JJZ9 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cngb3Q9JJZ9 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cngb3Q9JJZ9 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cngb3Q9JJZ9 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cngb3Q9JJZ9 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cngb3Q9JJZ9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cngb3Q9JJZ9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cngb3Q9JJZ9 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cngb3Q9JJZ9 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Cngb3Q9JJZ9 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Cngb3Q9JJZ9 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cngb3Q9JJZ9 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cngb3Q9JJZ9 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Cngb3Q9JJZ9 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cngb3Q9JJZ9 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cngb3Q9JJZ9 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cngb3Q9JJZ9 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cngb3Q9JJZ9 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cngb3Q9JJZ9 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cngb3Q9JJZ9 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Cngb3Q9JJZ9 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cngb3Q9JJZ9 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cngb3Q9JJZ9 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Cngb3Q9JJZ9 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cngb3Q9JJZ9 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cngb3Q9JJZ9 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cngb3Q9JJZ9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cngb3Q9JJZ9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms