Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIG4

Ppp1r3f, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 3F, mousemouse

Predictions only

Length 799 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1r3fQ9JIG4 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Ppp1r3fQ9JIG4 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
Ppp1r3fQ9JIG4 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Ppp1r3fQ9JIG4 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ppp1r3fQ9JIG4 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ppp1r3fQ9JIG4 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ppp1r3fQ9JIG4 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ppp1r3fQ9JIG4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ppp1r3fQ9JIG4 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ppp1r3fQ9JIG4 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ppp1r3fQ9JIG4 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Ppp1r3fQ9JIG4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
Ppp1r3fQ9JIG4 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ppp1r3fQ9JIG4 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ppp1r3fQ9JIG4 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ppp1r3fQ9JIG4 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ppp1r3fQ9JIG4 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ppp1r3fQ9JIG4 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ppp1r3fQ9JIG4 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ppp1r3fQ9JIG4 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ppp1r3fQ9JIG4 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ppp1r3fQ9JIG4 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ppp1r3fQ9JIG4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ppp1r3fQ9JIG4 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ppp1r3fQ9JIG4 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ppp1r3fQ9JIG4 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ppp1r3fQ9JIG4 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ppp1r3fQ9JIG4 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ppp1r3fQ9JIG4 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ppp1r3fQ9JIG4 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ppp1r3fQ9JIG4 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ppp1r3fQ9JIG4 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ppp1r3fQ9JIG4 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ppp1r3fQ9JIG4 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Ppp1r3fQ9JIG4 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ppp1r3fQ9JIG4 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ppp1r3fQ9JIG4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ppp1r3fQ9JIG4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ppp1r3fQ9JIG4 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ppp1r3fQ9JIG4 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Ppp1r3fQ9JIG4 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Ppp1r3fQ9JIG4 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Ppp1r3fQ9JIG4 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ppp1r3fQ9JIG4 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ppp1r3fQ9JIG4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ppp1r3fQ9JIG4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ppp1r3fQ9JIG4 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ppp1r3fQ9JIG4 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ppp1r3fQ9JIG4 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ppp1r3fQ9JIG4 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Ppp1r3fQ9JIG4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Ppp1r3fQ9JIG4 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Ppp1r3fQ9JIG4 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ppp1r3fQ9JIG4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ppp1r3fQ9JIG4 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ppp1r3fQ9JIG4 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ppp1r3fQ9JIG4 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ppp1r3fQ9JIG4 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ppp1r3fQ9JIG4 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ppp1r3fQ9JIG4 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ppp1r3fQ9JIG4 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ppp1r3fQ9JIG4 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ppp1r3fQ9JIG4 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Ppp1r3fQ9JIG4 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ppp1r3fQ9JIG4 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ppp1r3fQ9JIG4 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ppp1r3fQ9JIG4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Ppp1r3fQ9JIG4 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Ppp1r3fQ9JIG4 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Ppp1r3fQ9JIG4 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Ppp1r3fQ9JIG4 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Ppp1r3fQ9JIG4 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Ppp1r3fQ9JIG4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Ppp1r3fQ9JIG4 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ppp1r3fQ9JIG4 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ppp1r3fQ9JIG4 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Ppp1r3fQ9JIG4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ppp1r3fQ9JIG4 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ppp1r3fQ9JIG4 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ppp1r3fQ9JIG4 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ppp1r3fQ9JIG4 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ppp1r3fQ9JIG4 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms