Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHJ5

Htr3b, 5-hydroxytryptamine receptor 3B, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htr3bQ9JHJ5 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Htr3bQ9JHJ5 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Htr3bQ9JHJ5 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Htr3bQ9JHJ5 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Htr3bQ9JHJ5 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Htr3bQ9JHJ5 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Htr3bQ9JHJ5 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Htr3bQ9JHJ5 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Htr3bQ9JHJ5 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Htr3bQ9JHJ5 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Htr3bQ9JHJ5 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Htr3bQ9JHJ5 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Htr3bQ9JHJ5 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Htr3bQ9JHJ5 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Htr3bQ9JHJ5 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Htr3bQ9JHJ5 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Htr3bQ9JHJ5 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Htr3bQ9JHJ5 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Htr3bQ9JHJ5 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Htr3bQ9JHJ5 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Htr3bQ9JHJ5 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Htr3bQ9JHJ5 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Htr3bQ9JHJ5 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Htr3bQ9JHJ5 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Htr3bQ9JHJ5 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Htr3bQ9JHJ5 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Htr3bQ9JHJ5 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Htr3bQ9JHJ5 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Htr3bQ9JHJ5 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Htr3bQ9JHJ5 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Htr3bQ9JHJ5 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Htr3bQ9JHJ5 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Htr3bQ9JHJ5 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Htr3bQ9JHJ5 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Htr3bQ9JHJ5 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Htr3bQ9JHJ5 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Htr3bQ9JHJ5 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Htr3bQ9JHJ5 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Htr3bQ9JHJ5 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Htr3bQ9JHJ5 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Htr3bQ9JHJ5 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Htr3bQ9JHJ5 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Htr3bQ9JHJ5 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Htr3bQ9JHJ5 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Htr3bQ9JHJ5 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Htr3bQ9JHJ5 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Htr3bQ9JHJ5 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Htr3bQ9JHJ5 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Htr3bQ9JHJ5 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Htr3bQ9JHJ5 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Htr3bQ9JHJ5 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Htr3bQ9JHJ5 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Htr3bQ9JHJ5 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Htr3bQ9JHJ5 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Htr3bQ9JHJ5 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Htr3bQ9JHJ5 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Htr3bQ9JHJ5 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Htr3bQ9JHJ5 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Htr3bQ9JHJ5 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Htr3bQ9JHJ5 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Htr3bQ9JHJ5 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Htr3bQ9JHJ5 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Htr3bQ9JHJ5 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Htr3bQ9JHJ5 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Htr3bQ9JHJ5 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Htr3bQ9JHJ5 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Htr3bQ9JHJ5 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Htr3bQ9JHJ5 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Htr3bQ9JHJ5 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Htr3bQ9JHJ5 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Htr3bQ9JHJ5 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Htr3bQ9JHJ5 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Htr3bQ9JHJ5 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Htr3bQ9JHJ5 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Htr3bQ9JHJ5 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Htr3bQ9JHJ5 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Htr3bQ9JHJ5 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Htr3bQ9JHJ5 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Htr3bQ9JHJ5 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Htr3bQ9JHJ5 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Htr3bQ9JHJ5 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Htr3bQ9JHJ5 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Htr3bQ9JHJ5 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Htr3bQ9JHJ5 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Htr3bQ9JHJ5 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Htr3bQ9JHJ5 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Htr3bQ9JHJ5 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Htr3bQ9JHJ5 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Htr3bQ9JHJ5 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Htr3bQ9JHJ5 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Htr3bQ9JHJ5 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Htr3bQ9JHJ5 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Htr3bQ9JHJ5 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Htr3bQ9JHJ5 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Htr3bQ9JHJ5 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Htr3bQ9JHJ5 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Htr3bQ9JHJ5 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Htr3bQ9JHJ5 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Htr3bQ9JHJ5 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Htr3bQ9JHJ5 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 131.3 ms