Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQM6

Dgcr8, Microprocessor complex subunit DGCR8, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dgcr8Q9EQM6 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Dgcr8Q9EQM6 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Dgcr8Q9EQM6 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Dgcr8Q9EQM6 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Dgcr8Q9EQM6 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Dgcr8Q9EQM6 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Dgcr8Q9EQM6 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Dgcr8Q9EQM6 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Dgcr8Q9EQM6 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Dgcr8Q9EQM6 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Dgcr8Q9EQM6 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Dgcr8Q9EQM6 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Dgcr8Q9EQM6 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Dgcr8Q9EQM6 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Dgcr8Q9EQM6 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Dgcr8Q9EQM6 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Dgcr8Q9EQM6 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Dgcr8Q9EQM6 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Dgcr8Q9EQM6 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Dgcr8Q9EQM6 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Dgcr8Q9EQM6 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Dgcr8Q9EQM6 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Dgcr8Q9EQM6 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Dgcr8Q9EQM6 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Dgcr8Q9EQM6 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Dgcr8Q9EQM6 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Dgcr8Q9EQM6 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Dgcr8Q9EQM6 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Dgcr8Q9EQM6 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Dgcr8Q9EQM6 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Dgcr8Q9EQM6 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Dgcr8Q9EQM6 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Dgcr8Q9EQM6 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Dgcr8Q9EQM6 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Dgcr8Q9EQM6 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Dgcr8Q9EQM6 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Dgcr8Q9EQM6 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Dgcr8Q9EQM6 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Dgcr8Q9EQM6 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Dgcr8Q9EQM6 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Dgcr8Q9EQM6 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Dgcr8Q9EQM6 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Dgcr8Q9EQM6 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Dgcr8Q9EQM6 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Dgcr8Q9EQM6 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Dgcr8Q9EQM6 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Dgcr8Q9EQM6 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Dgcr8Q9EQM6 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Dgcr8Q9EQM6 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Dgcr8Q9EQM6 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Dgcr8Q9EQM6 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Dgcr8Q9EQM6 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Dgcr8Q9EQM6 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Dgcr8Q9EQM6 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Dgcr8Q9EQM6 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Dgcr8Q9EQM6 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Dgcr8Q9EQM6 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Dgcr8Q9EQM6 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Dgcr8Q9EQM6 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Dgcr8Q9EQM6 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Dgcr8Q9EQM6 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Dgcr8Q9EQM6 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Dgcr8Q9EQM6 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Dgcr8Q9EQM6 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Dgcr8Q9EQM6 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Dgcr8Q9EQM6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Dgcr8Q9EQM6 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Dgcr8Q9EQM6 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Dgcr8Q9EQM6 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Dgcr8Q9EQM6 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Dgcr8Q9EQM6 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Dgcr8Q9EQM6 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Dgcr8Q9EQM6 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Dgcr8Q9EQM6 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Dgcr8Q9EQM6 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Dgcr8Q9EQM6 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Dgcr8Q9EQM6 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Dgcr8Q9EQM6 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Dgcr8Q9EQM6 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Dgcr8Q9EQM6 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Dgcr8Q9EQM6 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Dgcr8Q9EQM6 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Dgcr8Q9EQM6 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Dgcr8Q9EQM6 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Dgcr8Q9EQM6 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Dgcr8Q9EQM6 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Dgcr8Q9EQM6 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Dgcr8Q9EQM6 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Dgcr8Q9EQM6 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Dgcr8Q9EQM6 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Dgcr8Q9EQM6 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Dgcr8Q9EQM6 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Dgcr8Q9EQM6 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Dgcr8Q9EQM6 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Dgcr8Q9EQM6 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Dgcr8Q9EQM6 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Dgcr8Q9EQM6 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Dgcr8Q9EQM6 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Dgcr8Q9EQM6 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Dgcr8Q9EQM6 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms