Protein–RNA interactions for Protein: Q9EP93

Vmn1r53, Vomeronasal type-1 receptor 53, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r53Q9EP93 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Vmn1r53Q9EP93 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Vmn1r53Q9EP93 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Vmn1r53Q9EP93 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Vmn1r53Q9EP93 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Vmn1r53Q9EP93 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Vmn1r53Q9EP93 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vmn1r53Q9EP93 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vmn1r53Q9EP93 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vmn1r53Q9EP93 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Vmn1r53Q9EP93 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vmn1r53Q9EP93 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vmn1r53Q9EP93 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vmn1r53Q9EP93 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Vmn1r53Q9EP93 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Vmn1r53Q9EP93 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Vmn1r53Q9EP93 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Vmn1r53Q9EP93 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Vmn1r53Q9EP93 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Vmn1r53Q9EP93 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Vmn1r53Q9EP93 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vmn1r53Q9EP93 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vmn1r53Q9EP93 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vmn1r53Q9EP93 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vmn1r53Q9EP93 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vmn1r53Q9EP93 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vmn1r53Q9EP93 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vmn1r53Q9EP93 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vmn1r53Q9EP93 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vmn1r53Q9EP93 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vmn1r53Q9EP93 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Vmn1r53Q9EP93 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Vmn1r53Q9EP93 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Vmn1r53Q9EP93 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vmn1r53Q9EP93 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Vmn1r53Q9EP93 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vmn1r53Q9EP93 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vmn1r53Q9EP93 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vmn1r53Q9EP93 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vmn1r53Q9EP93 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vmn1r53Q9EP93 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vmn1r53Q9EP93 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vmn1r53Q9EP93 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vmn1r53Q9EP93 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vmn1r53Q9EP93 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Vmn1r53Q9EP93 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vmn1r53Q9EP93 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vmn1r53Q9EP93 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vmn1r53Q9EP93 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vmn1r53Q9EP93 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vmn1r53Q9EP93 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vmn1r53Q9EP93 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vmn1r53Q9EP93 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Vmn1r53Q9EP93 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vmn1r53Q9EP93 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vmn1r53Q9EP93 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vmn1r53Q9EP93 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vmn1r53Q9EP93 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vmn1r53Q9EP93 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vmn1r53Q9EP93 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vmn1r53Q9EP93 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vmn1r53Q9EP93 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vmn1r53Q9EP93 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vmn1r53Q9EP93 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vmn1r53Q9EP93 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vmn1r53Q9EP93 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vmn1r53Q9EP93 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Vmn1r53Q9EP93 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vmn1r53Q9EP93 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vmn1r53Q9EP93 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vmn1r53Q9EP93 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vmn1r53Q9EP93 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vmn1r53Q9EP93 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vmn1r53Q9EP93 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vmn1r53Q9EP93 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vmn1r53Q9EP93 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Vmn1r53Q9EP93 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vmn1r53Q9EP93 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vmn1r53Q9EP93 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vmn1r53Q9EP93 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vmn1r53Q9EP93 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vmn1r53Q9EP93 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vmn1r53Q9EP93 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Vmn1r53Q9EP93 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vmn1r53Q9EP93 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vmn1r53Q9EP93 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vmn1r53Q9EP93 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vmn1r53Q9EP93 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vmn1r53Q9EP93 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vmn1r53Q9EP93 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vmn1r53Q9EP93 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Vmn1r53Q9EP93 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Vmn1r53Q9EP93 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Vmn1r53Q9EP93 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Vmn1r53Q9EP93 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Vmn1r53Q9EP93 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Vmn1r53Q9EP93 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Vmn1r53Q9EP93 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vmn1r53Q9EP93 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vmn1r53Q9EP93 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms