Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC53

Cpne8, Copine-8, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne8Q9DC53 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cpne8Q9DC53 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cpne8Q9DC53 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cpne8Q9DC53 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cpne8Q9DC53 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cpne8Q9DC53 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cpne8Q9DC53 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cpne8Q9DC53 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cpne8Q9DC53 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cpne8Q9DC53 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cpne8Q9DC53 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cpne8Q9DC53 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Cpne8Q9DC53 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cpne8Q9DC53 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cpne8Q9DC53 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cpne8Q9DC53 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cpne8Q9DC53 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cpne8Q9DC53 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cpne8Q9DC53 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cpne8Q9DC53 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cpne8Q9DC53 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cpne8Q9DC53 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cpne8Q9DC53 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cpne8Q9DC53 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cpne8Q9DC53 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cpne8Q9DC53 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cpne8Q9DC53 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cpne8Q9DC53 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cpne8Q9DC53 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cpne8Q9DC53 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cpne8Q9DC53 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cpne8Q9DC53 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cpne8Q9DC53 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cpne8Q9DC53 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cpne8Q9DC53 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cpne8Q9DC53 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cpne8Q9DC53 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cpne8Q9DC53 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cpne8Q9DC53 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cpne8Q9DC53 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cpne8Q9DC53 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cpne8Q9DC53 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cpne8Q9DC53 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cpne8Q9DC53 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cpne8Q9DC53 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Cpne8Q9DC53 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cpne8Q9DC53 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cpne8Q9DC53 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cpne8Q9DC53 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cpne8Q9DC53 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cpne8Q9DC53 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cpne8Q9DC53 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cpne8Q9DC53 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cpne8Q9DC53 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cpne8Q9DC53 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cpne8Q9DC53 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Cpne8Q9DC53 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Cpne8Q9DC53 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cpne8Q9DC53 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cpne8Q9DC53 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cpne8Q9DC53 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cpne8Q9DC53 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cpne8Q9DC53 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Cpne8Q9DC53 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cpne8Q9DC53 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cpne8Q9DC53 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cpne8Q9DC53 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cpne8Q9DC53 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cpne8Q9DC53 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cpne8Q9DC53 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cpne8Q9DC53 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cpne8Q9DC53 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cpne8Q9DC53 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cpne8Q9DC53 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cpne8Q9DC53 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Cpne8Q9DC53 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cpne8Q9DC53 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cpne8Q9DC53 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cpne8Q9DC53 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cpne8Q9DC53 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cpne8Q9DC53 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cpne8Q9DC53 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cpne8Q9DC53 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cpne8Q9DC53 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cpne8Q9DC53 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cpne8Q9DC53 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cpne8Q9DC53 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cpne8Q9DC53 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cpne8Q9DC53 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cpne8Q9DC53 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cpne8Q9DC53 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cpne8Q9DC53 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cpne8Q9DC53 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cpne8Q9DC53 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cpne8Q9DC53 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cpne8Q9DC53 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cpne8Q9DC53 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cpne8Q9DC53 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cpne8Q9DC53 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cpne8Q9DC53 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms