Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBC3

Cmtr1, Cap-specific mRNA (nucleoside-2'-O-)-methyltransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtr1Q9DBC3 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Cmtr1Q9DBC3 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cmtr1Q9DBC3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cmtr1Q9DBC3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cmtr1Q9DBC3 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Cmtr1Q9DBC3 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cmtr1Q9DBC3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cmtr1Q9DBC3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cmtr1Q9DBC3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cmtr1Q9DBC3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cmtr1Q9DBC3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cmtr1Q9DBC3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cmtr1Q9DBC3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cmtr1Q9DBC3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cmtr1Q9DBC3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cmtr1Q9DBC3 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cmtr1Q9DBC3 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cmtr1Q9DBC3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cmtr1Q9DBC3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cmtr1Q9DBC3 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cmtr1Q9DBC3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cmtr1Q9DBC3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cmtr1Q9DBC3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cmtr1Q9DBC3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cmtr1Q9DBC3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cmtr1Q9DBC3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cmtr1Q9DBC3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cmtr1Q9DBC3 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Cmtr1Q9DBC3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cmtr1Q9DBC3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cmtr1Q9DBC3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cmtr1Q9DBC3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cmtr1Q9DBC3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cmtr1Q9DBC3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cmtr1Q9DBC3 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cmtr1Q9DBC3 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cmtr1Q9DBC3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cmtr1Q9DBC3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cmtr1Q9DBC3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cmtr1Q9DBC3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cmtr1Q9DBC3 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cmtr1Q9DBC3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cmtr1Q9DBC3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cmtr1Q9DBC3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cmtr1Q9DBC3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cmtr1Q9DBC3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cmtr1Q9DBC3 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cmtr1Q9DBC3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cmtr1Q9DBC3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cmtr1Q9DBC3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cmtr1Q9DBC3 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cmtr1Q9DBC3 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cmtr1Q9DBC3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cmtr1Q9DBC3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cmtr1Q9DBC3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cmtr1Q9DBC3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cmtr1Q9DBC3 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cmtr1Q9DBC3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cmtr1Q9DBC3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cmtr1Q9DBC3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cmtr1Q9DBC3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cmtr1Q9DBC3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cmtr1Q9DBC3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cmtr1Q9DBC3 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cmtr1Q9DBC3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cmtr1Q9DBC3 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cmtr1Q9DBC3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cmtr1Q9DBC3 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cmtr1Q9DBC3 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cmtr1Q9DBC3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cmtr1Q9DBC3 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cmtr1Q9DBC3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cmtr1Q9DBC3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cmtr1Q9DBC3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cmtr1Q9DBC3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cmtr1Q9DBC3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cmtr1Q9DBC3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cmtr1Q9DBC3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cmtr1Q9DBC3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cmtr1Q9DBC3 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Cmtr1Q9DBC3 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cmtr1Q9DBC3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cmtr1Q9DBC3 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cmtr1Q9DBC3 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cmtr1Q9DBC3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cmtr1Q9DBC3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Cmtr1Q9DBC3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cmtr1Q9DBC3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cmtr1Q9DBC3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cmtr1Q9DBC3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cmtr1Q9DBC3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cmtr1Q9DBC3 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cmtr1Q9DBC3 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cmtr1Q9DBC3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cmtr1Q9DBC3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cmtr1Q9DBC3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cmtr1Q9DBC3 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cmtr1Q9DBC3 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cmtr1Q9DBC3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cmtr1Q9DBC3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms